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4091 个回答

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Tajima's D 计算结果出图空白。

你的vcf数据有问题,窗口里面都没有SNP:

回答于 2022-01-11 09:29

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#fst 与 pi 联合 筛选受选择区域

fst和Pi滑窗用的窗口和步长要统一,不然脚本无法合并相同的窗口进行汇总绘图:

回答于 2022-01-10 14:34

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#Fst 群体间多样性差异 vcftools --gzvcf $gzvcf --fst-window...

可能前面的变量没有设置: 你运行一下: echo $step  echo $window 看看有么有值输出,检查变量设置问题; 建议不要用记事本编辑文件,可能出现linux和windows编码问题导致错误,用notepad++

回答于 2022-01-10 12:38

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pi多样性绘图输入文件有数据,但绘图空白

两个文件的染色体编号不统一,你需要统一一下;

回答于 2022-01-10 10:00

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转录组基因时间聚类-Mfuzz的示例数据课程里面没有

资料在百度网盘链接里面,你可以重新打开链接看一下:

回答于 2022-01-09 13:51

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docker运行中出现segmentation fault,用的示例数据

我们测试了这个镜像是没有问题的:omicsclass/pop-evol-gwas:v1.2 如果输入的数据没问题,那可能是win10的系统问题,建议换个电脑试试。 有可能是内存不够,设置问题,https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2022-01-08 20:10

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ref 换成水稻的,群体进化计算pi #pi多样性绘图输出为空白,不知...

把所有的输入文件都截图贴一下,我才好给你分析哪里的问题; 初学者,一般都是输入文件格式搞错了;

回答于 2022-01-07 17:22

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如何通过mcscanX找基因家族的Segmental?我在跑mcscanX时得到的c...

对的,这是共线性的区域文件

回答于 2022-01-07 09:26

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pop_group.txt文件应该怎么正确准备,Gwas视频里准备文件格式,...

课程里面有例子文件,你可以对比看看;  group文件的样本数量和vcf里面的样本数量可能不等吧,你核对一下数据;

回答于 2022-01-07 09:25

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老师好!用root权限删除了linux系统下的根目录: /* 。如何恢复?

恢复 很困难, 建议重新安装系统吧;

回答于 2022-01-07 09:23