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老师您好,我根据您的方法从GFF信息,从基因组里提取基因的蛋白...

你再下载这个基因家族 2.0的镜像,之前的镜像没有更新这个命令; 2.0用法一样的,软件有更新; 或者你操作了基因组这一步之后,再回到v1.0.1 分析数据也行; docker pull omicsclass/gene-family:v2.0

回答于 2023-04-07 10:51

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查看基因组文件里面有哪些信息时,除了CHr还有NSCAFA等其他的,...

其他是一些没有挂载到染色体的序列,也是基因组里面的序列,就是不知道属于哪条染色体;

回答于 2023-04-06 09:51

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请问在获取基因与mRNA的对应关系这一步,会出现提示说mRNA没有相...

看看这个:https://www.omicsclass.com/article/2032

回答于 2023-04-06 09:50

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老师好,请问共线性分析得到的collinearity文件里面的基因对是哪...

collinearity文件中是segmental基因对 kaks计算,tendam和segmental基因对都可以计算

回答于 2023-04-04 10:49

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进入docker镜像,命令却粘贴不了了

power shell 中鼠标右键是复制粘贴你试试

回答于 2023-04-04 10:47

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基因组注释 genome.chain 文件生成问题

简化下你的contig序列的ID名字,不要太长,和出现特殊字符在里面;

回答于 2023-04-02 20:23

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老师,perl编程课里的ePCR网址无效是怎么回事呀

用镜像里面的epcr就行,这个软件不官方不支持了

回答于 2023-03-31 21:40

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请问使用iTOL网站进行进化树绘制使用的是什么数据,测序对象是高...

进化树绘制用的是进化树; 进化树构建可以用很多数据,基因序列,snp,高通量测序的数据也行;

回答于 2023-03-29 09:53

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重复序列注释问题

是deep TE运行报错吗? 看看有结果输出吗?如果有结果输出就忽略这个报错; deep TE这个报错已经更新,你可以删除镜像重新下载即可

回答于 2023-03-29 09:52

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重复序列注释问题

前面运行正确的步骤可以在命令最左边加#注释掉就不会跑了; mithunter 没有跑成功,就把相应的文件夹删除,重新运行repeat sh 就行; 你是在我们的docker里面分析数据吗? 如果不是可能是软件安装问题;

回答于 2023-03-26 15:18