omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师您好，请问我在基因组重复序列注释，使用了repeatmasker、re...

是不是 GFF没有排序，你重新下载shell脚本，这部分我们更新了一下：https://www.omicsclass.com/article/2098

回答于 2023-05-16 15:34

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如果要得到SNP，对于基因组可以用基于参考基因组的方法做SNP变异

回答于 2023-05-11 09:10

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还有一个输出文件，你没有指定，你再看看课程吧

回答于 2023-05-08 09:22

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重复序列不好组装出来，建议加册O NT数据试试吧；或者用10X辅助组装

回答于 2023-05-04 14:03

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现在数据下载迅雷即可，速度也很快：https://www.omicsclass.com/article/1703

回答于 2023-05-04 14:01

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那你按照课程里面的方法挂载吧，3d-DNA没用过不清楚

回答于 2023-05-04 14:00

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有需要可以增加数据库，主要的结果注释有了就行；

回答于 2023-05-04 13:59

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我又测试了一下示例数据，今天上午投递的正常跑的, 马上就要跑完了；

回答于 2023-04-28 17:48

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输入文件都截图看看的，不同文件染色体ID不对应吧

回答于 2023-04-27 16:23

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可以试一下podman，一个docker替代工具建议使用docker，或者购买我们组学大讲堂的服务器，里面安装了docker

回答于 2023-04-27 14:10