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泛基因组
内存有300G， 这个参数（nucmer --maxmatch -g 1000 -c 90 -l 40 -t 5 -p $query ref.fa $query.fa）该怎么设可以不超过内存？-t 10 改成了-t 5， 其他还需要改吗？改成-t 5 。 我的基因组有12个个体，每个个体大约有2.5G，怎么设置这个大小？
回答于 2026-10-14 08:35
04.snp_indel.sh
内存有300G 还不够吗？如果我去掉--maxmatch 参数就可以运行，nucmer -g 1000 -c 90 -l 40 -t 10 -p $query ref.fa $query.fa，不知道这样有没有影响？怎么样可以减少内存使用，需要-t 10 参数改小点吗？
回答于 2026-10-01 08:28
泛基因组
conda install hcc::sequencetubemap 我用conda 安装这个软件后，可以使用吗？用这个命令安装后没有报错，但是找不到sequencetubema软件。
回答于 2026-08-05 17:40
重测序额质控
我这是把用vcftools 把染色体分开了，可能是丢失了QD 值是不是？我再咨询一下，由于样本比较多，我想把这个文件把染色体分开 然后并行过滤，怎么操作？
回答于 2026-06-29 09:16
02.3.ASTRAL
附件是我的文件，你看看，我都是复制粘贴的，应该都是一致的。astral.species pop sliding_out.trees.rmNA
回答于 2026-03-16 12:00
LD 分析
用这个命令画出来是这样的（Plot_MultiPop.pl -inList ld_stat.list -output ld_stat.multi -bin1 100 -bin2 10000 ），怎么让图更平滑
回答于 2026-03-10 12:42