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已经windows系统里下载了docker 也打开了,但还是运行不了. doc.sh
George
2024-12-17 15:13
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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析,输入了51个样本,但是最后就剩下了35个样本,如图所示,请问是那一步出现错误了,是 数据有问题还是写的参数有问题
16S
deblur
zhangzhang
2024-08-31 20:24
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不知道为什么,产生不了unmap文件
宏基因组
George
2024-12-23 09:44
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想请教一下,我是基于windows+docker做的宏基因组注释,然后在去宿主这一步,卡住了 不知道为啥 一直不动
宏基因组
George
2024-12-20 19:09
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###16S/18S 方法1:dada2 数据质量过滤,合并,去嵌合,去引物一步完成。这个步骤代码报错,请老师帮我看一下这个问题,之前有帖子也有这个问题,说是建议下载咱们课程提供的docker镜像,我就是下载的咱们课程的docker镜像,但还是出现了这个问题,请老师解答,谢谢!
dada2
16S
zhangzhang
2024-08-30 20:31
1
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16s分析,数据导入过程中出现了问题,请问怎样解决?
qiime2
云海
2024-09-29 10:57
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请问,我弄了一个256线程,1t内存的服务器,想处理500G的宏基因组注释,大概需要跑多少天,全套下来
宏基因组
George
2025-01-01 07:11
1
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物种注释出现killed,我调了参数还是出现这个问题,除了用台式机或者服务器之外还有别的办法吗?
qiime2
云海
2024-10-31 23:52
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771
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想咨询一下,宏基因组功能注释的视频中,有一步是用cds.fa文件注释物种,想咨询一下,这个物种注释出来后,应该如何计算丰度?是根据前面cds.count来计算吗,这样计算出的物种丰度可靠吗?因为有些物种可能基因很多。
宏基因组
George
2025-01-02 02:36
1
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想知道出现A2这种情况是因为数据的原因吗
九夏微凉
2024-09-11 16:23
1
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
宏基因组
George
2025-01-02 02:39
1
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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表,混合组装呢
基因丰度表
murakami
2024-12-17 17:32
1
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binning 想做功能注释,但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释?
宏基因组
George
2025-01-02 14:56
1
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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗?
TPM
murakami
2024-12-17 16:39
1
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592
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
George
2025-01-02 02:39
1
回答
561
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想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像,谢谢
宏基因组
George
2024-12-14 12:48
1
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532
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binning物种注释的时候,gtdbtk软件和数据包已经更新,旧版的匹配不上,请问应该怎么更新一下软件,谢谢
宏基因组
George
2025-01-02 11:44
2
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529
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想咨询一下老师,这个图大概是咋做出来的,应该用到什么样格式的数据,在网上没搜到教程,主要是需要什么数据,谢谢老师
1
George
2025-03-12 12:54
2
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为啥这个. doc.sh后,显示不是内部或外部命令,也不是可运行的程序
George
2024-12-17 11:10
0
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您好,想和您咨询一下,我用土壤样本测微生物宏基因组注释,40个样本,一共500g左右,想和您咨询一下,一定要用服务器吗,普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗,感谢感谢
注释文件
George
2024-12-13 18:54
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