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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗？

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

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20 想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像，谢谢

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想咨询一下老师，这个图大概是咋做出来的，应该用到什么样格式的数据，在网上没搜到教程，主要是需要什么数据，谢谢老师

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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CAZy注释阶段，hmmer的太慢占用cpu只有一直很少

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为啥这个. doc.sh后，显示不是内部或外部命令，也不是可运行的程序

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您好，想和您咨询一下，我用土壤样本测微生物宏基因组注释，40个样本，一共500g左右，想和您咨询一下，一定要用服务器吗，普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗，感谢感谢

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想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

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lefse分析细节

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

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想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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您好，想和您咨询一下，我用土壤样本测微生物宏基因组注释，40个样本，一共500g左右，想和您咨询一下，一定要用服务器吗，普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗，感谢感谢

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老师 请问这个运行时需要很久吗，上面显示的需要7天

  • Oho 2025-03-08 15:13
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老师我在解压eggnog.db.gz文件时显示失败

  • Oho 2025-03-08 09:57
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在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，

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老师您好，我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错，出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决？