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组装叶绿体基因组时修改方向revseq这个命令，是只反向，还是要反向互补？

  • yuyu 2023-12-07 19:49
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老师运行“ls aln_out/*.cds_aln.fasta |while read a;do sed -r 's/([A-Za-z]+_[A-Za-z]+)_.*/\1/g' $a > $a.renamed;done”后得到的结果single_copy.cds_msa.fasta是空的文件夹是空的，这怎么解决呀

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老师，这行命令出来的结果是空的，怎么解决呀

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hgmd,omim,lovd数据库

  • WDH 2023-12-07 16:51
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老师，为什么不能运行ParaAT/ParaAT.pl，我检查路径是对的

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老师我想问一下，MENA在analysis the network 报错的问题

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root@jieyuma-virtual-machine:/home/jieyuma/Desktop# docker search omicsclass Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dial tcp: lookup index.docker.io on 127.0.0.53:53: server misbehaving

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群体研究合辑work.sh脚本运行问题

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gemma分析时，有的样本表型数据缺失怎么办？

  • 2023-12-06 19:39
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老师，为什么不能用diamond?

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gatk VariantFiltration这一步的过滤，我看到gatk 官网上SNP和indel的过滤条件有点不一样。是否可以把SNP和indel从all.raw.vcf.gz提取出来个各自硬过滤后再合并做后面的分析？

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老师我想问一下，基因家族鉴定出来的结果里有一些基因是假基因，做后续分析的时候要不要把它们删除呢

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R包安装

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构建系统发育树读取分组失败

  • 231 2023-12-06 11:06
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老师，这怎么解决

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使用Bedtools在关联区域找SNP过程中报错：VCF文件的fields不够

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使用Bedtools在关联区域找SNP过程中报错：VCF文件的fields不够

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gVCF文件转换成VCF格式时，已经在后台运行了很久了，突然程序关闭了，报错信息显示：

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用于动物基因家族成员的顺式作用元件分析的数据库

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mcscanX能否用于动物基因组内基因家族的共线性分析？