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gatk无法利用csi索引

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binning功能注释

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在运行core_pan_gene_curve.r的时候报错

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请问功能注释里面，想注释KEGG

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3 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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如何启用已下载好的数据库

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老师们好，在生成gvcf文件合并vcf文件时，出现这种警告信息，请问是什么原因，如何处理啊？

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基因型文件里面包含了snp和indel，怎么Indel和表型进行关联分析，是需要把vcf文件转换一下格式嘛，具体代码是什么，期待老师的解答

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泛基因家族分析cds提取出现killed

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不知道为什么，产生不了unmap文件

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SoupX去除污染RNA

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vcftools 过滤等位基因。 老师，用的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz，然后进行等位基因过滤，生成文件很小是为啥啊，我看过滤条件也不严格啊

  • Max 2024-12-21 21:52
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基因家族两个结构域

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基因家族一个基因的两个结构域序列重叠

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想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了 不知道为啥 一直不动

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KEGG富集分析

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有关于GSEA富集分析参数设置

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基因组偏大

  • Song 2024-12-19 22:18
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怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200份数据

  • Max 2024-12-19 17:16