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转录组基因表达差异分析分组问题，我是有3个样品数据，如下分别是Carambola_K007-01-T01（花序），Carambola_K007-01-T02（花苞），Carambola_K007-01-T01（叶），该如何分组呢

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最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，改了后还是出现以下问题

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请问使用MCScanX绘制物种内基因共线性出现了共线性连接，但是使用circos绘制彩图的时候，为什么内部所有的线性关系都无法显示啊？

  • Llm 2019-09-17 16:29
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最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，应该是脚本的问题，具体问题如下

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10 基因家族共线性绘图时

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甲基化数据做WGCNA，beta值过低怎么办

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基因家族成员命名

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请教：基因与mRNA的对应关系分析不正确

  • zhoy 2019-09-15 20:42
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biolinux

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如何通过转录组测序结果geneID“TRIAE_CS42_6DL_TGACv1_527316_AA1702110”找到对应的“TraesCS4A02G403700”这样的ID？

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不同物种之间的共线性分析

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生存分析报错

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生存分析datExpr数据的bcr_patient_barcode列是 . 号分隔，后续报错

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如何针对没有基因组，只有无参转录组数据，鉴定筛选一个基因的家族成员并进行分析

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老师请问我想解压.rar文件，然后在网站http://www.rarsoft.com/download.htm下载安装RAR 5.80 beta 1 for Linux x64，make后为何报这个错误？

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5 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

  • ollo 2019-09-12 20:44
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基因在不同组织的表达量做热图

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就是在学习RNA-Seq数据差异分析时，出现上调和下调都为0的情况，全都是没有差异的基因，是否需要修改参数设置？

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老师您好，我做共线性分析时，只生成了一个PDF文件，没生成karyotype.pdf，麻烦老师帮我解答一下

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关于基因家族共线性分析：MCScanX和circos都可以做共线性分析，有区别吗