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MEGA7.0

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我在构建进化树的时候，分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特点，但发现有的成员分类错误，采用ML法，校正参数Bootstrap设置为1 000次重复，结果出来后却发现，AtLC10本应该在第二组，AtLC13应该在第三组，但实际的结果恰恰相反，之后我又换了NJ法，结果还是不理想，依然有成员分组混乱，不知道我是哪里做的不对，希望得到指导。（AtLC10:AT5G01190.1,AtLC13:AT5G07130.1）

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老师好！我的物种基因注释水平在scaffold，之前课程里面的思路和脚本是否还适用？我需要有什么注意事项？附有参考文献分析方法和数据。求老师指导。感谢！

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删除哪个？

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想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算。我的数据热图用Row-z-score画完结果显示与实际数值不大对，选column好像才对。

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发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的domain、cdd的domain的位置不一样，有长有短，怎么办

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RNA-seq分析建立基因组index遇到问题

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MCScanX共线性分析出错，请问如何解决？

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启动子分析，使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错（不能读取脚本第21行），请问该怎么修正啊？

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ITOL最近打不开

2 解决

3 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

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请问blastp比对后再提取结构域，结果是空文件，这是怎么回事呢？

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/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 运行不下去，出现下面的情况，请问是不是我的python有问题？

  • 2019-11-25 10:38
2 解决

分化时间计算中的r值

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TBtools无法使用和更新

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运行meme motif analysis时报错，无meme文件，locate也找不到biosoft或meme-v4.12.0

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请问这种作物模型图怎么做呀

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老师您好，我在安装GraphPad Priam时，老是出现如下问题，换了几个下载地址都是这样的问题，一直安装不了。求解决方法！！！

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10 用CoNet进行OTU互作网络分析时如何筛选去网络中的关键节点、枢纽或者物种（network hubs）？

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老师您好,我在用conet对自己数据分析时,总是报错，具体数据格式有什么要求吗