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15 有关MCscanX共线性分析时一些冷门物种（芦笋，NCBI下载的文件）蛋白质序列的处理问题

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请问一下在做mcscan分析的时候pep.fa文件里只有3w多条蛋白序列，后面得到的AT.collinearity文件里显示9w多基因是什么意思啊？

  • 荣 2020-08-10 12:50
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8 更改文件及perl脚本后get_gene_weizhi.pl提取文本依旧为空。

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5 老师！求解答！在TCGA数据基因ID转换中出错！!

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你好请问有植物转录因子基因调控网络预测的教程吗，我看到过期了

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Max Quant 打不开.fasta文件

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docker-GSDS网站出错：Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

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麻烦老师问一下，在把sra文件转换成fastq文件时，怎么会出现这种情况？

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R语言首次调用gdc-client，下载失败

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老师您好！

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在GDC数据库下载数据出错

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睡神15分钟前 你解决了吗？我也遇到了这种情况，单个基因能显示顺式作用元件，我再一个一个加上去，最多两个显示作用元件，剩下的 都是CDS了，GeneID 特殊符号 格式什么的都试过了，还是不行

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基因家族分析Mcscan分析时，无法提取蛋白序列。

  • 荣 2020-08-07 09:56
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有公开发表的基因家族分析文章做了家族成员是否存在假基因的鉴定，请问具体怎么鉴定？

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怎么辨别鉴定的家族成员中是否有假基因？

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我是你们客户，帐号13971529286，需要RNAseq转录组分析资料。请提供。谢谢

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你好 老师 关于cytoscape中conet插件的问题

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老师，我用的get_gene_gff.pl的gff3文件是这种的

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老师您好! 我用get_gene_gff.pl提取基因在染色体上的位置信息时，得到的结果文件没有第一列基因ID，并且数量多出来了好几千，我的基因只有一百多个，请问老师这种该怎么处理呀? 我改了ID=gene为ID=也一样没有用

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老师您好! 我用samtools faidx获取染色体长度时有一个segmentation default 报错，老师让我看看是不是文件里的序列长度不一致，请问老师具体该怎么处理呀? 我用软件打开基因组文件看了一下，但看不懂。