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GEOquery 下载不了数据

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老师您好，我根据课程步骤的指令，改不了文件的格式，我能找到format_fa_for_qiime.pl文件，还把它放到了操作的文件夹，但是电脑找不到这个文件，是什么原因呢

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老师好，我按照课程输入指令后，没有更改文件格式，是哪里出问题了

  • 2020-12-24 10:58
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老师，您好，微生物多样性分析课程里质控数据统计分汇总中的$scriptdir/qc_stat.qc脚本是样本名称吗，下载了公众号的文件，没找到scripts文件，这一步不知道怎么运行了

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5 老师，微生物多样性分析课程资料中没有找到scripts文件，微生物多样性分析中的质控数据统计除了用$scriptdir下的文件还可以用其他的吗？

  • 2020-12-23 14:40
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你好，batch cd search 没有任何信息出来是因为什么呢

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多样性数据实操 OTU注释报错

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16s注释报错

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Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决

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大家好，我想问一下，在转录组测序结果中FDR显示--是检测不出来还是其他的意思？

  • 2020-12-19 17:28
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老师，请问在进行共线性分析时，出现ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.是什么原因呀？

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测序数据质控中Q20、Q30是什么意思？包括合同中写的Q30大于80%。

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请教大家问题，做转录组分析，在做差异表达的时候，可不可以同时比较三个组

  • Iron 2020-12-18 11:20
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5 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

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10 WGCNA中想做一个样本——模块热图，求指教

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15 公司的结题报告中，出现一个lncRNA有多种外显子情况

  • 2020-12-16 11:09
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老师您好，有个基因家族鉴定分析的问题想咨询您

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如何大批量将核苷酸序列转为蛋白序列

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老师，您好，转录组分析时，比对完reads，进行sam文件转换为bam文件，不报错，只出现killed,如图中情况，老师帮忙解答一下！

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基因与mRNA的对应关系（两个，一个mRNAid_to_geneid，一个geneid2mRNAid），两个文件一般都是相等，那不相等的话意味着什么呢？