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请问从http://firebrowse.org/?cohort=BRCA&download_dialog=true 下载的甲基化数据，里面的甲基化探针cg号转换为基因名？

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群体课程里面 得到的Fst区间 如何合并区间并计算相应的Fst值？

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5 为什么ssr引物设计结果为空

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请问老师能分享一下基因家族分析的代码吗

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3 共线性分析报错

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bedtools intersect -wo -nonamecheck -F 0.1 -a region_merged.bed -b $vcf >var.txt

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老师您好，在下载的镜像omicsclass/blast-plus中使用hmmsearch显示如下，应该怎么处理呢

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老师您好，如何将TCGA中下载的CNV数据：GDC_Aliquot转为Hugo_Symbol, Segment_Mean转变为拷贝数变异的5个离散值（0：无变化 1：拷贝数增加 2：高水平扩增 -2：纯合性缺失 -1：半合子缺失）。如下图所示

  • moli 2022-02-17 08:58
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老师，我这是结构域所在序列用GeneDoc比对的结果，288个基因比对，没有课程里那纯黑色百分百相似的区域正常吗

  • 2022-02-16 20:51
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老师，MEGA里用WRKY_pep_confirmed.fa和WRKY_domain_confirmed.fa文件做比对都是点击protein吗

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用denovo的方法进行otu聚类的时候报错是什么原因？ killed

  • MZ 2022-02-16 17:17
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利用emmax进行GWAS分析

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老师，请问下两次hmmsearch的结果一样正常吗?

  • 2022-02-15 12:56
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老师，您好，我目前处于GWAS新手状态中，您能叫我下怎么获取数据吗？

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老师您好，我购买了ceRNA分析的网上课程，在下载TCGA数据时出现问题，提示pre_miRNA_miRBase_v22.tsv文件找不到，想请教下老师这个文件怎么获得，谢谢！

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10 基因家族分析--定量问题

  • 2022-02-11 22:30
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群体遗传进化分析课程中，如下图所示利用run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个代码并没有在01.phylo_tree文件夹中得到supergene.phy的文件

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请问老师做PCA分析时提示Segmentation fault是什么原因，该怎么解决呢

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老师你好，我想问我在通过cox回归建立lncrna预后模型，最后通过多因素cox回归分析得到的结果，发现有些基因的p值＞0.05，这些基因是不是要剔除

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10 基因家族分析

  • 2022-02-08 23:17