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叶绿体基因组组装后，java启动gepard软件进行序列比对选择时

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我在进行比对的时候就无论怎样都报错Warning: [Errno 2] No such file or directory: '/home/chn/文' (ERR): Read file '/home/chn/文' doesn't exist Exiting now ...求大佬解惑

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请问老师，我计算的测序深度1×才61.41% ，这个数值是很低嘛？课程中的值都达到90%多了。这个测序深度只要是看哪一个呢？

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关于基因组注释中mysql 语句创建用户的问题

  • 2023-08-12 22:20
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kmer分析与最后组装基因组大小不同

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600 进行bugbase运行时候老报错

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做选择清楚分析的时候，pi_manhattan_plot.r -i FS_C.windowed.pi -F $FAI -f 19226500 -n pi.wild，出现这样的报错，输出文件也没有数值

1 解决

基因结构信息统计脚本报错

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cafe做基因家族扩张和收缩，报错Failed to initialize any reasonable values

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motif筛选的条件

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想问一下，边界分析做出的图，和它描述的序列特征表中的各个区的长度不一致的话，是正常的吗？会不会有什么影响呢 叶绿体分析

  • 2023-08-11 10:51
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老师好，为什么我用杓兰七个物种的fasta组装起来比对后用DnaSP做出的图是这样的呢？跟老师您做出来的图存在差异，请问老师是对数据进行处理吗?

  • 2023-08-11 10:06
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docker怎么设置镜像以及内存，最后一张图是基因家族分析课程里面介绍的，但是docker v24.0.5版本中docker engine的界面完全不一样；然后请问memory内存如何能扩大呢

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老师好，请问用DnaSP计算出来的Pi值和Theta值都是一样的，是不是数据处理出错了呢

  • 2023-08-10 17:54
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tassel新报错，求老师们看一下[Thread-8] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 0 out of bounds for length 0

  • kid 2023-08-10 16:18
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叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed，内存从10G改为30G又改成70G，但是还是不行，程序终止。

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hifiasm结果偏大怎么办，是什么原因呢

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同源四倍体可以用purge_dup去冗余吗

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植物叶绿体组装后，发现结果不成环状，要怎样调整其成环呢

  • 2023-08-08 21:22
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老师，您好！我在用-SortGenotypeFilePlugin排序vcf文件时，得出来的文件比原始文件小很多。

  • QCJ 2023-08-08 16:56