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RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗
有参转录组课程的z主要是分析mRNA 的，lnc RNA 数据如果是模式物种，GFF里面有注释lnc RNA，也可以分析；其他miRNA 环状RNA分析不了；
回答于 2025-02-25 19:12
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做基因家族，需要下载图片中哪些文件？Genome Gff CDS Protein d...
用课程的脚本，只需要下载genome染色体序列文件和GFF注释文件就行
回答于 2025-01-22 09:32
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在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师...
这两个脚本没有在scripts文件夹下的话，就是打包到了docker镜像里了。可以通过在镜像里面提取这个脚本，然后复制到自己服务器上去使用。不过有些软件脚本写的复杂，不是简单复制即可运行，复杂的软件会有很多依赖简单复制不一定能运行，需要按要求安装软件才能正常运行。比如安装 AGAT这个软件；不会安装直接使用我们的云服...
回答于 2024-12-24 11:10
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基因家族一个基因的两个结构域序列重叠
是数据库网站二次确认显示两个结构域是残基并且相互重叠？可以参考这个基因家族的相关文献。如果是结构域残基就需要舍弃这个结果
回答于 2024-12-23 17:40
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基因家族两个结构域
具体的基因家族可以去搜索相关文献，看其它文章是怎么鉴定这个基因家族成员的，看两个结构域分别hmmsearch之后应该取交集还是并集。最终确定基因家族成员之后，再去提取结构域序列、蛋白全长序列进行后续分析。
回答于 2024-12-23 17:32