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139 个回答

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老师,在做蛋白预测的时候总是显示desired structure doesnot ex...

可能网络不太好。下载不下来这个文件。可以自己去PDB数据库搜索下载对应6ir8的pdb格式文件

回答于 2025-07-15 14:07

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想获得某个染色体序列,命令是啥?

根据输入的reg.bed文件内容提取对应固定区域(region)序列:seqtk subseq in.fa reg.bed > out.fa 准备bed文件:[基因所在染色体 基因起始位置 基因终止位置] 参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/2190

回答于 2025-07-14 09:20

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泛基因家族分析结构变异与基因表达分析

GRAS_gene_fpkm.xls  输入文件有问题。将首行首列“gene_id”改为“ID”。跟示例文件列名保持一致

回答于 2025-07-09 17:56

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泛基因家族分析数据准备

软连接成功了

回答于 2025-07-08 14:48

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老师,我做共线性分析时,出现了以下错误,什么也生成不出来

输入文件有问题,可以把运行命令截图发一下,检查一下文件

回答于 2025-07-08 10:58

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老师,我的Fam_gene.list、PAV_draw.list、PAV_gene.list都正常...

你的数据文件里面是不是除了这2个PHY基因外,都是核心PHY基因。绘图脚本会“移除在所有品系里面都存在基因的行”。你如果想将这种情况的结果也绘制出来的话,就需要改脚本。将PAV_heatmap.r中第62行首添加“#”号注释掉该行。再去运行。

回答于 2025-07-07 15:24

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序列相似的家族基因如何设计荧光定量引物?

按照引物设计流程直接设计就行。手动引物设计推荐网站:https://www.omicsclass.com/question/297

回答于 2025-07-07 09:39

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老师,这是我做出来的PAV热图,每个基因都是物种独有的,这个PAV...

确实结果不好,可以再check一下前面步骤和泛基因列表步骤,是不是有什么问题导致的没有同源基因

回答于 2025-07-05 19:21

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泛基因筛选最长转录本时出现问题

将id.txt文件中不需要再跑的品系ID删除再循环跑就可以了。跑之前将前面生成的空文件删除。不过最好先看一下报错原因,为什么生成的空文件

回答于 2025-07-04 09:11

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泛基因家族分析数据准备

可以的,都是一样的内容

回答于 2025-07-04 09:07