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209 个回答

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将基因组序列文件和注释文件批量链接到当前文件夹 对每一个gff文...

't' 的符号要用英文单引号

回答于 2026-04-27 10:14

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下载pfam数据库有问题,其中h3m文件为0

基因家族分析课程里面不需要下载pfam数据库。在鉴定步骤里只需要下载结构域的隐马尔科夫模型即可

回答于 2026-04-24 17:54

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各位老师好,请问我研究的是玉米泛基因家族,学习了泛基因的课程...

不是所有的基因家族都存在非常保守的结构域和由结构域构建的HMM模型。这种情况可以不选择hmmer鉴定,只选择blast鉴定的方法。具体可以借鉴该基因家族已发表的相关文献

回答于 2026-04-21 10:11

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数据准备 检查变量对应有问题

检查一下env.sh文件中定义的变量路径正不正确

回答于 2026-04-20 09:08

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提取CDS时出现问题?使用的命令如下,但是不能成功运行。请问老...

报错提示输入gff数据有问题,检查一下每个基因有没有漏写CDS区域

回答于 2026-04-16 09:07

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成功启动镜像,进入容器,把课程资料下载到本地并解压缩,还是找...

你us329@omicsclass是在我们服务器上?不是在本地,里面没有本地数据。进入镜像后root@账户里面的路径,要看你启动镜像的命令中路径映射。想要找到本地的数据,只能在本地启动镜像

回答于 2026-04-02 11:34

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成功启动镜像,进入容器,把课程资料下载到本地并解压缩,为什么...

截图显示data课程资料在pan-gene-family文件夹下。镜像中你还没进入到pan-gene-family文件夹里面

回答于 2026-04-02 10:47

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转录组kegg富集,deg emsembl id不存在

物种表格包含你分析的物种吗? 可以使用eggnog数据库注释

回答于 2026-02-09 14:29

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泛基因家族分析做PVA绘图时,总共20个样本,每次绘图后就剩19个

可以吧运行命令截图一下,有报错吗

回答于 2026-01-29 21:36

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老师下面这个问题怎么解决呀,我换一个物种他就可以完成,

运行报错了,检查一下输入ID列表文件,或直接去fa文件中根据ID搜索基因是否存在,注意文件编码系统:https://www.omicsclass.com/article/1727

回答于 2026-01-26 10:17