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老师你好,我购买了“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”,在sparcc...

会修改环境变量吗?  把这个文件的最后一行修改一下;   ~/.profile 用默认的python就可以了:

回答于 2019-09-20 11:32

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请问R/QTL这个包可以用来做果树群体的qtl定位吗?

可以分析,基因型分析可以做群体的重测序得到SNP按照不同的基因型进行分型; https://rqtl.org/  Rqtl 包做QTL定位,还有map QTL做定位的:https://www.kyazma.nl/index.php/MapQTL/

回答于 2019-09-20 09:52

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我下载了你们课程里的linux,可以用自己的电脑进行bwa基因组比对...

数据量太大的话,应该不可以,要么分析速度很慢,要么你的电脑吃不消,硬件达不到,存储内存等; 建议使用linux服务器分析高通量测序数据;

回答于 2019-09-20 09:48

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关于小麦基因家族中的同源性问题

染色体组之间做共线性分析,可以发现同源基因,具体可以参考文献:https://www.omicsclass.com/article/990 我们的基因家族分析课程里面有共线性分析视频建议学习:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-09-20 09:46

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请问进行基因组比对BWA软件如何安装

建议使用我们提供的biolinux虚拟机里面已经安装好了bwa,无需安装;https://www.omicsclass.com/article/526 安装方法: wget https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bwa-0.7.17.tar.bz2tar -jxvf bwa-0.7.17.tar.bz2cd bwa-0.7.17make  linux基础不好建议学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析...

回答于 2019-09-19 17:43

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hisat2 reads 与基因组进行比对出错

命令报错了,没有运行成功,所以没有结果,检查命令行是否写错,记得这里应该用引号引起来; 转录组数据分析课程推荐: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2019-09-19 15:26

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生信小白,想要从头学起,但不知道需要学习哪些课程?

生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-09-19 09:42

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你好,老师,我使用virusdetect这个软件的时候,为什么会容易报...

索引没有建立成功吧,或者命令写错了?

回答于 2019-09-19 09:41

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基因家族分析中的在界定完基因家族后,序列比对是只用基因的doma...

hmmer搜索之后就可以得到结构域的所在的位置,就可以在蛋白序列上截取;

回答于 2019-09-19 09:37

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转录组基因表达差异分析分组问题,我是有3个样品数据,如下分别...

没有生物学重复,无法用edgeR做差异分析; 建议用ebseq包

回答于 2019-09-19 09:36