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Blast分析筛选不到串联重复基因
你看看你基因的注释信息gff文件，mRNA和cds有啥区别；如果有区别：mRNA序列有可能比cds序列多UTR部分； 串联重复分析有两种方法：blast方法，和mcscanX方法任选其一。
回答于 2019-10-08 10:50
KaKs问题，想问一下，有没有关于单子叶植物突变速率相关的文章，...
这个得自己查阅相关文献，这里有人回答：https://www.omicsclass.com/question/1318 双子叶的可以参考：https://www.omicsclass.com/question/896
回答于 2019-10-06 11:03
我做了重测序，进行了变异检测，有没有相关类型的文章可以借鉴借...
做了重测序有了变异信息，可以做 单基因遗传病分析，可以做癌症体细胞突变分析，可以做GWAS分析，可以做遗传进化分析，可以做BSA关联分析，可以做遗传图谱分析等等可以做很多，自己可以搜索相关文献；不知道你要做什么？
回答于 2019-10-06 11:00
关于mcscan的问题
mcscan会自动删除染色体名称中的字母：https://www.omicsclass.com/question/1161 不带数字的染色体名字mcscan会报错：https://www.omicsclass.com/article/572
回答于 2019-10-06 10:50
Mapchat导入文件不能作图
基因位置顺序按照从小到大排列，报错那个基因你调整一下位置； 参考：https://www.omicsclass.com/article/397
回答于 2019-10-06 10:46
老师您好，我在用vi打开并修改文件后无法退出，就是在安装MCScan...
vi按esc键进入命令模式之后，按 ZZ 保存退出 linux基础不好，加快学习进度建议学习：linux系统使用 里面都有详细讲解；
回答于 2019-10-06 10:43
下面R语言while循环中为甚输出的不是最后一个值？
x为向量，索引每运行一次 i 就会增加，所以x的索引在不断的变化，不同的值存在不同的位置，最后x 为向量输出； R语言学习建议：R语言快速入门与提高
回答于 2019-10-06 10:41
老师好，我想问一下，RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢？rea...
read counts是测序之后每个基因测到的reads数量，可用于做差异分析，因为做差异分析的软件要求输入原始reads数；例如DESeq2等等； FPKM和TMP，RSEM等都是对reads进行标准化，只是计算方法不一样：https://www.omicsclass.com/article/615，方便比较； 因为一个基因测到的reads数量与他的基因长度，表达量，测序数据量有关...
回答于 2019-10-06 10:38