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4089 个回答

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WGCNA 选择基因作热图的问题

这些基因是随机挑选的,为了绘图方便(基因少绘图时间短);你也可以不用挑选,直接绘图

回答于 2019-12-31 09:50

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共线性 ZeroDivisionError: float division by zero

看看这个,染色体ID可能不一致:https://www.omicsclass.com/question/1361

回答于 2019-12-31 09:48

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MCscan运行问题:ZeroDivisionError: float division by zero

还可以排查一下染色体名称: 可以看看这个:https://www.omicsclass.com/question/1605  还有这个:https://www.omicsclass.com/article/572

回答于 2019-12-31 09:48

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rawdate表格已经截图,求再帮忙看下

你的group 样品分组变量建立有问题,建议你自己整理一个分组文件,第一列为样本ID,第二列为分组名称,然后用read.table读入: ####################手动制作分组group变量###############################################3 #从文件读取分组信息, #group.txt文件格式: # Id group # TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31 Tumor...

回答于 2019-12-31 09:40

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运行出错,edgeR做差异分析,报错NA counts not allowed

检查一下rawdata这个表格变量是否有问题,里面是否是基因在样本中的count值,是否含有NA。

回答于 2019-12-30 17:46

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多序列比对构树

如果序列相似性高,是可以直接构建进化树的。 但是,有时候序列差异到,无法构建进化树,所以需要手动或者借助软件删除一些差异大的区域,保留保守的区域构建进化树。

回答于 2019-12-30 17:40

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McscanX找组内复制基因,组间复制基因

不明白你的意思,不等也算正常,为啥要一定相等呢?

回答于 2019-12-30 09:40

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MCsanX运行报错

可以看看这个:https://www.omicsclass.com/question/1605  还有这个:https://www.omicsclass.com/article/572 再有检查所有文件里面的染色体ID 是否一致:https://www.omicsclass.com/question/1361

回答于 2019-12-30 09:39

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基因家族分析时,顺式作用元件提取只能提取列表中的一部分基因,...

你检查一下,有个基因的位置有问题,他所在的位置比他所在的染色体还要长。

回答于 2019-12-30 09:38

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Fig Tree

导出pdf应该是没有问题的。 建议使用evolview这个软件编辑美化进化树试试:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-12-30 09:37