用以下配置文件会更好: chromosomes_units=1000000 #刻度单位Mbkaryotype=./chr.info #染色体信息配置文件show_tick_labels=yesshow_ticks=yesspacing=10u<ticks> #设置染色体刻度 color=black format=%d multiplier=1e-6 radius=1r thickness=2p <tick> size=10p sp...
回答于 2020-02-24 10:04
这些参数和最终的绘图有关,可以稍加调整重新绘图,看看图片有啥变化,第一行是表头; 详情可看这里:https://www.omicsclass.com/article/284
回答于 2020-02-23 19:17
这个python版本的mcscan 显示染色体的时候只会显示染色体上的数字, 建议那些太短的scaffold就不要显示了,也没有共线性关系。
回答于 2020-02-23 19:12
共享目录设置方法见:https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2020-02-23 11:46
不要批量运行代码,初学者应该一行一行的运行代码确保每一步代码的运行意义,以及是否运行正常。 如果批量运行,很难找到错误原因;
回答于 2020-02-23 11:45