你是下载数据吗? 下载临床数据参考:https://www.omicsclass.com/article/1125
回答于 2020-01-31 11:09
把所有的视频都看一下,在对应的参考资料里面有下载那个打包文件,解压之后里面有script文件夹里面;
回答于 2020-01-31 11:05
目前ordb支出的物种见:http://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___OrgDb 不同的物种之间不能混用,因为基因ID的对应关系不一致; 如果上面没有对应的物种,可以参考这个:https://www.omicsclass.com/article/302
回答于 2020-01-18 14:51
检查你输入的序列里面的的ID是否有重复的,如果有重复的会出现输入不进去。 参考:https://www.omicsclass.com/question/1621
回答于 2020-01-10 09:30
SNPCalling 两种方法: samtools结合bcftoolsGATK 以上两种方法任选其一就可以
回答于 2020-01-10 09:27
当然可以了,你可以找到GEO中甲基化芯片数据,然后再利用R语言中相应的R包进行分析就可以了。
回答于 2020-01-09 11:17
脚本要求输入gff格式的文件才可以正常运行,不要输入gtf格式的文件,会报错; 请 下载参考基因组里面对应的gff文件再运行此脚本。 另外,gff文件是可以转换成gtf文件,但是gtf文件无法转换成gff文件。
回答于 2020-01-09 11:12