你是在做基因家族加倍与复制分析吗? 如果不是,我这不好给你回答,因为不知道你的分析目的 如果是在查找基因家族成员的加倍与复制,可以保留,单独说明一下就可以; 但是,不能说是串联重复或者大片段复制;
回答于 2019-12-24 11:35
illumina的芯片数据可以下载这个文件进行数据处理: GEO数据介绍:https://www.omicsclass.com/article/1100
回答于 2019-12-23 13:43
不知道你要改成什么样子? 你可以看看例子拟南芥的GFF文件和你的对比一下缺失什么: 看你的GFF文件缺少 gene行,你应该添加上: 还有我们的脚本会读取第九列,ID和Parent信息。
回答于 2019-12-23 11:16
可以用R语言中的p.adjust() 函数完成矫正: p.adjust(p, method = p.adjust.methods, n = length(p))p.adjust.methods# c("holm", "hochberg", "hommel", "bonferroni", "BH", "BY",# "fdr", "none")
回答于 2019-12-23 11:13
安装我们组学大讲堂提供的biolinux虚拟机,里面安装了很多软件:https://www.omicsclass.com/article/526 no such device 可以卸载vbox重新安装老版本的vbox: https://download.virtualbox.org/virtualbox/5.2.38/VirtualBox-5.2.38-136252-Win.exe
回答于 2019-12-23 11:11
如果想自行安装circos软件可参考这个课程,里面有详细的安装讲解:linux系统使用 如果安装不了建议导入我们组学大讲堂提供的biolinux:https://www.omicsclass.com/article/526
回答于 2019-12-23 11:09