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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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TCGA癌症-基因表达差异分析

R代码用Rstudio打开,为避免乱码可以设置一下:https://www.omicsclass.com/article/294 R 基础不好建议学习,可以避免很多不必要的时间浪费: R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2020-03-30 10:43

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老师,请问我想分析水稻的某个基因家族,可是基因家族数量太大,...

这个我这不好给建议,你还是再看看文献,理清自己的分析思路吧;

回答于 2020-03-29 10:02

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老师,请问用megaX做进化树分析时,序列有22个,但是它老是弹出...

你是不是点错按钮的额,你再检查一下看看;

回答于 2020-03-29 10:01

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plantcare

耐心等待一下吧,一般得1-2天后发邮件,注意垃圾邮件也应该看看

回答于 2020-03-29 10:00

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老师您好,怎么删除相似度比较低的id呢

没明白你的相似度是什么意思,序列相似,还是ID名字相似?

回答于 2020-03-29 09:58

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docker pull下载镜像出现:error pulling image configuration:...

可能由于国外的docker hub下载很慢导致下载失败或者很慢: 方法1: 使用阿里云docker镜像加速,提升pull的速度:你只需要登录容器Hub服务 https://cr.console.aliyun.com的控制台,使用你的支付宝帐号,第一次登录时,需要设置一个独立的密码,左侧的加速器帮助页面就会显示为你独立分配的加速地址。修改配置文件: vim ...

回答于 2020-03-28 09:34

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老师,请问一下我在学习基因家族分析课程时,执行perl get_gene_...

你检查一下基因的ID,染色体ID文件之间是否统一。还有文件格式打开都看看

回答于 2020-03-27 14:02

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请问,在做WRKY基因家族分析提取结构域序列的时候perl script/do...

前提结构域序列肯定是;有必要 尽量多全;

回答于 2020-03-27 14:00

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老师您好,我看到您的文章里有批量修改序列ID的操作,那Figtree...

进化树美化修改颜色,可以用:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2020-03-27 13:27

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KaKs分析结果有三对,mscan分析结果有5对,且这5对中只有 2对和K...

这个分析方法不一样,挑选的条件不一样,结果不同也算正常,你选一个结果为准吧; 复制基因(包括串联重复,大片段复制,转座子转座等等)概念要弄明白,你要知道自己找的是什么基因,才好取舍。 更多可参考:https://www.omicsclass.com/article/1195

回答于 2020-03-27 13:25