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老师您好!用SNPhylo构建系统进化树,该如何输入input file?

这个建议阅读 SNPhylo软件的使用说明文档:http://chibba.pgml.uga.edu/snphylo/  介绍的很详细;

回答于 2020-03-26 13:16

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知道序列,怎么确定它是我们要研究的特定那个基因成员啊,求解

可以使用pfam,SMART,CDD等提交序列查询: PFAM :https://www.omicsclass.com/article/877 CDD:https://www.omicsclass.com/article/310 SMART https://www.omicsclass.com/article/681

回答于 2020-03-26 13:14

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老师您好,我用MEGA7.0做系统进化树的时候,基因ID中有分号,但...

把分号删除重新构建进化树

回答于 2020-03-26 13:12

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Linux系统中在删除GFF文件ID中不必要信息,如gene:时出现报错

可以不加  -i 修改文件; 或者用notepad++ 搜索替换

回答于 2020-03-25 20:29

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MCScanX报错

检查文件路径是否正确

回答于 2020-03-25 20:28

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请问老师,这个报错是为什么啊

检查文件路径是否都正确

回答于 2020-03-25 20:28

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老师从gff文件中用mRNAID_to_geneid.pl提取gene和mRNA之间的对应...

输入文件是不是GFF格式的检查一下; 可以把代码贴一下,不然不好分析原因;

回答于 2020-03-25 20:27

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显示导入虚拟电脑失败,想请问一下这种情况是什么原因呀?谢谢

ova文件下载的不完整,重新下载试一下:https://www.omicsclass.com/question/2413

回答于 2020-03-25 20:25

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老师您好,导入虚拟电脑失败,这种情况是什么原因呀?

ova文件下载的不完整,重新下载试一下:https://www.omicsclass.com/question/2413

回答于 2020-03-25 20:24

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老师您好,我的导入虚拟电脑总是失败,这种情况是什么原因呀?

ova文件下载的不完整,重新下载试一下:https://www.omicsclass.com/question/2413

回答于 2020-03-25 20:24