omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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ks计算物种共同祖先WGD事件的问题

基因不是不变的额，不断适应环境进化，所以我觉得有差别正常

回答于 2020-04-06 09:26

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说照顾色盲，你改一下重新运行：

回答于 2020-04-03 16:49

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有参转录组是做基因转录表达的，和直系同源基因没关系，也不会做这个

回答于 2020-04-03 12:56

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串联重复和大片段复制是不一样的，基因家族复制概念要弄清：https://www.omicsclass.com/article/730 mcscanX通过共线性分析查找大片段复制基因和串联重复基因，blast方法只能找到串联重复的基因；

回答于 2020-04-03 12:55

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输入文件都应该截图一下，我才好给你分析原因；这里我建议你把所有的输入文件都打开看一下，基因ID是否统一，再一个文件的格式和示例文件对比一下看看有没有异常。

回答于 2020-04-03 12:52

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gene_family,txt 这个文件和示例文件对比一下，我记得最开始有个名字；如果都检查没有问题的话，可能你的基因家族成员里面就没有大片段复制基因；运行这个脚本：detect_collinearity_within_gene_families.pl 检查一下有没有结果；

回答于 2020-04-03 12:09

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这个课程里面有详细讲解:基因家族分析实操课程、

回答于 2020-04-02 13:32

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输入文件都检查一遍，和示例文件对比看看哪里是不是出错；

回答于 2020-04-02 13:31

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有的，可以看看这个课程：https://www.omicsclass.com/article/275

回答于 2020-04-02 11:19

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vbox更新了，所以可能报错：https://www.omicsclass.com/question/2201/answer/2423

回答于 2020-04-02 09:33