omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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用hisat2软件建立index为什么要先制作splicesites.tsv和exons.ts...

基因组上的基因包含内含子，我们的测序转录组数据是MRNA不包含内含子，所以比对的时候索引有外显子信息，更易于比对； http://daehwankimlab.github.io/hisat2/manual/

回答于 2020-04-01 11:59

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提交到三大数据库，做后续结构域搜索

回答于 2020-04-01 11:53

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这些不是乱码，是软件运行过程中的一些log信息，你可以看看看的，乱码是你看不懂的；

回答于 2020-04-01 11:52

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恩，保留一个作为代表就可以

回答于 2020-04-01 11:51

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这个自己查找文献吧，老师没做过这方面的

回答于 2020-04-01 11:50

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换个好好些的电脑，

回答于 2020-04-01 11:49

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做顺势作用元件应该够用， hisat2建立索引不知道，没试过，你可以试一下就知道了；

回答于 2020-04-01 09:51

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课程里面说过，吧gene： transcript：等删除试试

回答于 2020-03-31 16:49

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目前没有别的办法，只能使用大内存的电脑，方法是有的，需要花钱才可以；比如买更多的内存，或者交给我们做；

回答于 2020-03-31 14:56

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建议学习这个课程里面有详细介绍：NCBI数据上传

回答于 2020-03-31 13:04