omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14485金币数
81900 经验值
447个粉丝
主页被访问 89420 次

4109 个回答

0 赞同

NCBI的数据库更新了,两份数据文件用哪个?

一个是CDS,一个文件是翻译后得蛋白序列文件吧,你下载下来用notepad++打开看看; 里面得README多看看

回答于 2020-04-15 13:12

0 赞同

关于KAKS的方法选择以及密码子选择

得查查原因吧,是序列差异太大计算不了,还是序列有问题

回答于 2020-04-15 13:11

0 赞同

老师你好,最近我在使用tbtool的blast时发生报错

没有用过tbtools里面的blast,可能软件安装还是有问题吧,建议使用biolinux里面的blast:https://www.omicsclass.com/article/526 或者使用我们的docker:https://www.omicsclass.com/article/1181  使用示例:https://www.omicsclass.com/article/1189

回答于 2020-04-15 13:10

0 赞同

如何提取一个冷门物种(NCBI下载)的CDS序列

可以看看这个问题,里面有些代码,你可以试试: https://www.omicsclass.com/question/584 建议学习perl: perl入门到精通、perl语言高级

回答于 2020-04-15 13:06

0 赞同

请问老师有没有get_gene_position.pl,get_gene_bed.pl,get_fa_...

脚本下载课程参考资料处下载:

回答于 2020-04-14 16:27

0 赞同

bootstrap consensus tree的nwk文件不能正常打开

MEGA 导出 nwk格式的进化树就好了

回答于 2020-04-14 13:27

0 赞同

老师您好,我想问下如何用hmmsearch在数据库中搜索同时具有两个...

搜索两次,结果去交集就好了; 不知道你的失败是啥意思? 结果没有,还是运行出错?

回答于 2020-04-14 13:25

0 赞同

老师您好,我在用plantcare分析启动子时,提交序列之后报错,具...

这个提交一个fasta文件吧:

回答于 2020-04-14 13:24

0 赞同

老师,请问用同样课程里的方法和代码,这一步就是报错,求解!谢...

截图不完整,你一行一行的运行代码,可能前面有代码没有成功; 你需要截图第一次出现错误代码的地方,我才好分析原因; 你的路径(DataDirectory)没有设置好吧,你检查一下;

回答于 2020-04-14 13:23

0 赞同

MCScan共线性分析画图问题

把所有基因ID后面的.1 去掉试试 删除所有文件结尾的空行

回答于 2020-04-14 13:20