华大 空间转录组与10X 公司比较
华大 空间转录组与10X 公司比较
Stereo-seq基于华大自主研发的DNBSEQ测序技术，利用携带空间条形码（Coordinate ID，CID）信息、规则阵列式排布的DNA纳米球（DNA Nano Ball，DNB），制备成时空芯片，原位捕获组织中的mRNA，并将其还原回原始空间位置，从而实现组织的空间分子检测。
分辨率比较：
相比较于其他技术平台，Stereo-seq在检测组织大小与分辨率等方面具有突破性优势，达到了0.5 微米，相对于10X的HD 2微米，分辨率更高：
芯片尺寸比较
芯片尺寸更丰富，还支持定制，捕获面积最大可达13cm×13cm，这一技术突破使得研究人员能够在更大的视野范围内以精细的分辨率观察和分析组织样本。因此可以将小鼠的整个胚胎放到芯片上捕获分析：
10X公司 捕获芯片大小有两种规格：6.5mmX6.5 和 11mmX11mm，分辨率最低55um，最高visium HD 达到2微米：
芯片材质：
10X公司的芯片barcode种在透明玻璃上，因此出来的空间转录组都是带底片的，更直观观察组织形态学上的差异：
而华大的为硅基芯片不透明，通常出来的数据不带有底片，组织形态上的展示不足：
但是最近SAW 8.3 软件（华大发表的用于自己空间转录组数据分析软件）更新后可以加入底片了，大家可以重新分析添加上底片：
空间转录组视频链接：https://bdtcd.xetlk.com/s/3Drd6v
- 发表于 2026-09-09 14:01
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- 分类：转录组
