GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总
单细胞数据挖掘示例代码
GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入：
IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践：https://www.omicsclass.com/article/1673
IF=6.68|
HCC肝癌单细胞数据挖掘实践： https://www.omicsclass.com/article/1677
BCC 基底细胞癌（GSE123813 count表格输入）：https://www.omicsclass.com/article/2483
BLCA膀胱癌(GSE192575 多样本10X)：https://www.omicsclass.com/article/2498
BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107 rds文件输入): https://www.omicsclass.com/article/2499
BRCA乳腺癌(GSE161529 多样本10X)：https://www.omicsclass.com/article/2500
UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829 多样本10X)：https://www.omicsclass.com/article/2512
肝细胞癌（HCC）(GSE149614 count表格输入)：https://www.omicsclass.com/article/2513
非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465 indrop数据) ： https://www.omicsclass.com/article/2515
非小细胞肺癌 （GSE139555 10X 多样本批量）:https://www.omicsclass.com/article/2532
结直肠癌 CRC(GSE146771 smart-seq2数据)：https://www.omicsclass.com/article/2516
结直肠癌 CRC(GSE178341 h5数据输入)：https://www.omicsclass.com/article/2518
头颈癌（HNSCC）(GSE181919 count表格输入)：https://www.omicsclass.com/article/2567
肺癌 LUAD （GSE123902 count 表格输入）： https://www.omicsclass.com/article/2725
肺癌 LUAD （GSE131907 count csv 转置 表格输入）： https://www.omicsclass.com/article/2724
拟南芥单细胞：https://www.omicsclass.com/article/2608
代码在单细胞转录组分析课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6
- 发表于 2024-06-11 17:18
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- 分类：转录组
