bioperl同时读取双端的fastq文件

bioperl同时读取双端的fastq文件

bioperl可以读取fastq文件,对其进行处理,而且一般是双端的序列,可以同时读取两个文件,方法如下:


while ( my $obj1=$fq1->next_seq() and my $obj2=$fq2->next_seq() ) {

    my ($id1,$id2)=($obj1->id,$obj2->id);

    ....

}

这样就可以同时读取read1、read2中的对应序列。


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  • 发表于 2018-11-16 17:41
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  • 分类:perl

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安生水
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