当保留蛋白编码序列时,为什么会提示有这个报错?检查发现'!'应该是没有输入错误的

原命令:agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3

报错:The test to apply is Wrong: !.

We want something among this list: <,>,<=,>=,! or =.
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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这是新版agat的bug,你删除镜像重新下载一下,更新一下,

这个已经在新镜像中更新解决了;


自己安装的AGAT需要自己手动解决bug:,60行修改如下:

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