HPA:人类蛋白图谱数据库

HPA:人类蛋白图谱数据库

1.  TISSUE ATLAS

    查看和分析蛋白编码基因在不同组织和器官中的表达情况 

    以PAX8为例

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2.    SINGLE CELL TYPE ATLAS

    单细胞类型图谱包含13种不同人体组织的单细胞RNA测序(scRNAseq)数据,以及内部生成的免疫组织化学染色组织切片,显示相应的空间蛋白表达模式。

    以blood & immune cell为例

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3.    PATHOLOGY ATLAS

提供了基因在肿瘤组织中的表达情况,以及生存分析,病理学图像等结果。

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4.    BRAIN ATLAS

大脑图谱通过可视化和整合三种哺乳动物物种(人类、猪和小鼠)的数据,探索哺乳动物大脑中的蛋白质表达。

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5.    BLOOD ATLAS

血液图谱包含人类蛋白质编码基因全基因组RNA表达谱的单细胞类型信息,包括各种B细胞和T细胞、单核细胞、粒细胞和树突状细胞

以CTLA4为例 

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6.    CELL ATLAS

细胞图谱提供了对人类细胞系中RNA和蛋白质的表达和时空分布的高分辨率洞察。全基因组的mRNA表达是通过对69个细胞系进行深度RNA测序来确定的,这些细胞系代表了人体不同器官和组织中的不同细胞群。

以CCNB1为例

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  • 发表于 2021-09-17 17:31
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