PlantPAN数据库

         植物启动子分析浏览器(PlantPAN; http://plantpan.itps.ncku.edu.tw)是针对植物基因预测调节原件和重建转录调节网络的有效资源。         PlantPAN3.0 的首页,包含六个模块,分别...

         植物启动子分析浏览器(PlantPAN; http://plantpan.itps.ncku.edu.tw)是针对植物基因预测调节原件和重建转录调节网络的有效资源。

        PlantPAN3.0 的首页,包含六个模块,分别是基因搜索、转录因子/转录因子结合位点搜索、基因集分析、启动子分析、跨物种和 ChIP-seq 搜索。

attachments-2020-07-pbZrJ1Wp5f0c2930b3af9.PNG

启动子分析


点击Promoter analysis,进入的页面为单个基因启动子序列的分析页面,还可选择多个基因的启动子序列分析以及在PCBase中分析

attachments-2020-07-JMvM2aKf5f0c299ebea25.png
步骤一:输入单个基因的启动子序列

步骤二:有两个选择:1)选择在PlantPAN中使用所有物种的启动子序列或者是自己勾选部分物种启动子序列;2)选择自己感兴趣的motif序列

步骤三:选择启动子其他元件

最后点击search即可


此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下:

1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程

2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接:

http://m.study.163.com/provider/400000000234009/index.htm?share=1&shareId=1433306807


  • 发表于 2020-07-13 18:10
  • 阅读 ( 147 )

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
Morii
Morii

2 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 327 文章
  2. 安生水 217 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. CORNERSTONE 72 文章
  6. 生信老顽童 48 文章
  7. 红橙子 47 文章
  8. landy 37 文章