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在GEO分析中遇见的问题

• GEO
• R

• lord of king 2020-02-03 00:43:58

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TCGA基因表达怎样和临床信息结合做生存分析

• TCGA
• R

• 漆黑烈焰の王 2020-01-27 19:52:11

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你好，老师，能用R语言软件分析GEO数据库中关于lncRNA、microRNA及DNA甲基化表达芯片吗？

• GEO
• R

• 赵明明 2020-01-08 17:47:00

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平台信息下载不下来，还有别的解决方法吗？

• GEO
• R

• 赵明明 2020-01-07 21:42:08

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请问老师，WGCNA分析后，得到模块里面基因太多，cytoscape做图的问题

• R
• WGCNA

• 王亚琪 2020-01-04 21:28:22

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list文件转化为data.frame文件

• R

• 小朱大夫 2019-12-31 21:48:50

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报错NA counts not allowed

• R
• TCGA
• edger

• euwa 2019-12-30 17:46:22

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8616浏览

运行出错，edgeR做差异分析，报错NA counts not allowed

• R
• edger

• euwa 2019-12-30 17:40:58

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5321浏览

无法分配大小为7.4 Mb的矢量

• R

• 张磊 2019-12-26 14:56:36

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4936浏览

bioconductor常用包 安装

• R
• bioconductor

• ggyyzy 2019-12-25 19:38:02

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4449浏览

相关系数矩阵

• WGCNA
• R
• OTU

• Mo 儿 2019-12-21 16:46:53

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8983浏览

wrong orderBy parameter; set to default `orderBy = "x"`

• KEGG
• R

• 小朱大夫 2019-12-18 14:23:49

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2936浏览

各位老师好，我在用R做生存分析时，读取了下载好的临床数据后（TCGA的)，提取病人编号，死亡时间等信息时报错“Can't find columns”，我对R的掌握实在过于疏浅，想请教老师们是否曾遇见过类似问题，如何解决呢？以下是问题截图

• R
• TCGA

• Joker 2019-12-18 13:34:02

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老师您好，我在网易云课堂上学习了您关于TCGA的诸多课程，现在在生存分析这一块使用您的代码实操，在运行到clin_info←datClin（）这一步后一直报错，提示不能发现病人代码，死亡日期等列，具体报错截图如下，还请指教

• TCGA
• R

• Joker 2019-12-18 11:41:20

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2684浏览

下载COAD数据提示列不一致保存不成功

• R
• TCGA

• 天堂水龙井茶 2019-12-03 03:38:31