...X染色体隐性遗传，母亲为致病基因携带者。 实验及数据分析 实验测序 由于父亲死亡，作者对母亲和三个儿子进行全外显子测序，使用Agilent SureSelect Human All Exon 捕获试剂盒建库，然后用 Illumina HiSeq 2000 平台双端测序，测序...
大神老师，您可以再共享一次HGMD数据库么 我们团队在做先心病的核心家系研究，基于60个家系发现novel associated mutation的文章倒是好写，但是易感突变在临床上其实意义不大，我们始终想在临床上把这些患者家系给诊断清楚，经...
...持动物miRNA靶基因的预测，但是大部分网站都很少更新，数据比较陈旧，今天就讲一个一直在更新的miRNA靶基因预测网站miRWalk。 1. miRWalk 简介 miRWalk是比较早的一款miRNA靶基因预测软件，第一版是在2011年发布，之后在2015年发布V2...
问题一：按课上老师教的筛选方法，网页上cases和file数量为何不一致（456和521），老师课上是一致的。 问题二：按老师的代码，样本总量不等于肿瘤+正常总和，为什么呢？ query <- GDCquery(project = "TCGA-COAD",data.category = "Tran...
数据介绍： 这个数据的表达量来自一篇泛癌文章，里面有很多项目的数据，其中就有这个数据，我们可以从中分离出来（GSE210347）： 文章地址PanCAF :https://www.nature.com/articles/s41467-022-34395-2 数据下载： wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih...
...的患者还没有特效的治疗方法。 文章： 分析思路： 数据介绍： 来自GEO两个表达数据，包括AMD患者和正常对照： 主要结果： 1.两个数据集，分别以患者和对照为分组筛选差异基因： 2. 共有的差异表达基因（107个）表...
...越来越年轻化。随着时代的发展和进步，我们能够从各大数据库网站找到开放的相关研究数据，包括GEO数据库、TCGA数据库等等。而基于现有的数据分析鉴定宫颈癌相关biomarker也是进行相关研究的一个方向，也有助于其他的科研...
老师，您好，我用GEO数据库的表达矩阵做WGCNA分析，总共34个样，表达矩阵中有60000多个基因，基因太多，如何进行筛选？WGCNA是否有处理这样大量数据的方法？
...在我毕业答辩的时候问我，为什么没有将雌雄转录组分开筛选功能基因。这个问题，也问住我了。我看绝大多数的文献都是直接从转录组中筛选自己想要的基因，很少有分雌雄的。希望老师能为我解答。
...型；Image Type：图片类型；Subsets：科研领域；Collections：数据库来源；Spcialties：学科专业 比如，文献类型包括论著、综述、Meta分析、会议论文、letter、病例报告等；图片类型包括了 CT、普通图片、MRI、显微图片、PET、X线、统计...
老师你好，我想请问一下我通过HMMER软件筛选了一批基因 但是我无法筛选他 E-value值筛选<0.0001的值怎么也筛选不了 请问有什么好办法进行解决？我想先筛选E-value值后在进行SMART分析结构域，万分期待您的答复。
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
老师，您好，我下载了别人发表的转录组数据，想拿结合做热图，但是文件太大，有十几个G，这样的文件该怎么打开筛选表达量数据呢
在前面的文章中，我们介绍了如何从TCGA中下载数据，但是那种方法下载的数据中包括了癌症相关各种类型的样本，而有时候我们只想分析其中的一种样本的数据，那该如何下载指定类型的数据呢？ 其实可以用TCGAbiolinks 软件包...
...组成有个基本的认识。 但是看懂了标准分析结果到利用数据撰写文章，还差一步，我们还需要对标准分析结果进行个性化分析才能用到文章里，下面我就来总结8个最常用的转录组个性化分析技巧（部分配图来自19年新发表的转...