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问题 vegan包问题请教

...w.names=1) > all <- specaccum(otu, method = "random")   > png(file="spe.png",h=2000,w=2000,res=300) > plot(all, ci.type = "poly", col = "blue", lwd = 2, ci.lty = 0, +      ci.col = "lightblue", main = "Species Accumulation Curves", xlab = "Number of samples", +      ylab = "...

问题 vegan包问题请教

...",row.names=1)> all <- specaccum(otu, method = "random")  > png(file="spe.png",h=2000,w=2000,res=300)> plot(all, ci.type = "poly", col = "blue", lwd = 2, ci.lty = 0,+      ci.col = "lightblue", main = "Species Accumulation Curves", xlab = "Number of samples",+      ylab = "Number...

文章 endnote 如何插入书籍引用

...分的SCI杂志都提供针对不同软件的文献引用文件（citation file）下载，下载到了这个文件直接导入文献管理软件（如 endnote等），就可以方便的把文献插入到自己论文当中，那些作者信息，文章题目，杂志名称等信息都可以自动帮...

问题 老师您好，我在进行GEO数据差异分析时，出现如下报错，请问我该如何解决？谢谢老师。

group_file.tsv

文章 获取virtualbox COM对象失败的处理办法

Failed to instantiate CLSID_VirtualBox w/ IVirtualBox, but CLSID_VirtualBox w/ IUnknown works. 我是 win7 64位 解决办法： 1， win+r 快捷键打开 “运行”，输入regedit 打开注册表 2，找到 HKEY_CLASSES_ROOT\CLSID\{00020420-0000-0000-C000-000000000046} Inproc...

文章 绘制Upset 图

...数据： #读入文件mydata<-read.table("Venn.txt",header=T,fill=T,check.names=FALSE,row.names = 1,na.strings="")head(mydata) 过滤基因： #去掉都不存的基因mydata <- mydata[rowSums(mydata) != 0, ] 绘图： upset(mydata,nsets = 10, #可视化数据集数量nintersec...

文章 Mac使用FileZilla连接服务器-SSH

Mac使用FileZilla连接服务器-SSH 文章标签： FileZilla 版权 Mac OS 10.14.x FileZilla 3.46.0 使用SSH，即通过sftp连接服务器前需要为FileZilla指明本机私钥位置。 在FileZilla中，导航栏FileZilla->Settings->Connection->SFTP->Add key file，会...

问题 借助转录组辅助基因组注释

...gnment.validation_loading.output sh: alignment.validations.output: No such file or directory Error, cmd: /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/scripts/update_alignment_status.dbi -M '/work/0509t2t/18.PASA/pasa.sqlite' < alignment.validations.output > pasa_run.log.dir/alignment....

问题 第一步文件导入qiime2一直出错，按照视频设置好

There was a problem importing /work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt:   /work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 1 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($datadir/SRR7441413_1.fastq) for sample "SRR7441413".

文章 windows安装Aspera Connect软件

...到软件的安装路径，默认安装一般会安到这里：C:\Program Files\IBM\Aspera Connect\bin，大家可以找一下或者搜索 ascp.exe 这个文件。 鼠标右键“我的电脑”选“属性”，选择“高级系统设置”，找到“环境变量(N)...”。 在系统...

文章 fasta格式文件介绍 What is FASTA format?

...息（description），描述信息可有可无 Sequences are expected to be represented in the standard IUB/IUPAC amino acid and nucleic acid codes, with these exceptions: lower-case letters are accepted and are mapped into upper-case;a single hyphen or dash can be used to represent a gap of ...

问题 在用tassel对vcf进行sort时报的错，有哪位大佬知道怎么操作吗

...Heap Size: 29809 Mb Use -Xmx option in start_tassel.pl or start_tassel.bat to increase heap size. Included with tassel standalone zip.

文章 Evolview：进化树设置标签的颜色

...l  第三列：控制命令 控制命令说明选项功能adapply color to all descendantsprefix将颜色应用到以第一列的字符起始的所有叶节点上suffix将颜色应用到以第一列的字符结尾的所有叶节点上anywhere将颜色应用到包含第一列的字符的所有叶...

问题 NJ 树脚本报错

...ne_tree_analysis -n NJ 报错为：os.rename('/'+args.outdir.strip()+'/outfile','/'+args.outdir.strip()+'/infile') FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '//work/gene_family_demo/03.gene_tree_analysis/outfile' -> '//work/gene_family_demo/03.gene_tree_analysis/infile' 请问...

问题 omicsclass/gene_family同时有latest和V1.0.1两个版本，挂载时出错

Error response from daemon: pull access denied for it, repository does not exist or may require 'docker login': denied: requested access to the resource is denied. 麻烦老师解答一下，之前听docker blast那里挺顺利的，在基因家族分析课这里卡住了