第一步文件导入qiime2一直出错，按照视频设置好

There was a problem importing /work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt:

/work/my_amplicon/A/manifest.ckd.txt is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:

Filepath on line 1 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($datadir/SRR7441413_1.fastq) for sample "SRR7441413".

datadir 这个变量设置有问题你需要重新设置一下：

运行的时候前面一定要加 export

omicsgene - 生物信息

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS | 采纳率 8% | 回答于 2021-12-20 17:59

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其它 1 个回答

chen chen 2021-12-30 23:07

楼主后来问题解决了吗，如何解决的？