...。然后发现，在软件GSEA，因为要上传cls文件，提供组别信息，如果我不把四组列出来，只列我想比较的两组，跑出来的结果也会有好多条我认为标志性的通路时反的。
...O GSE12417-array/GSE12417-GPL97_series_matrix.txt.gz#手动下载 GPL注释信息wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPLnnn/GPL96/annot/GPL96.annot.gz -O GSE12417-array/GPL96.annot.gzwget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPLnnn/GPL97/annot/GPL97.annot.gz -O GSE12417-a...
...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
...部分内容了，通常在“DEG_Analysis”文件夹里，我们需要的信息也不多，有差异基因的ID那一列即可，如下图第一列： 将各个比较组的差异基因ID整理到一个表里即可，对应关系要记好： 二、在作图网站填入数据： 打开网站...
...因家族分析类文章的期刊，供您投稿时参考！ 此Excel包含信息如下：期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科... 总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊，闲暇之余，小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期...
...OUP1那一行，删除 A或者用命令gpasswd -d A GROUP 8、显示用户信息id usercat /etc/passwd 更详细的用户和用户组的解说请参考Linux 用户和用户组详细解说本文主要讲述在Linux 系统中用户(user)和用户组(group)管理相应的概念；用户(user)和用...
...列：要显示的基因名称，不显示的都用NA。 4.添加上下调信息列-regulated data$regulated <- case_when(data$log2FC > log2(fc_cutoff) & data$FDR < fdr_cutoff ~ "up", data$log2FC < -log2(fc_cutoff) & data$FDR < fdr_cutoff ~ "down", ...
...介 MAFFT是一种流行的多序列比对软件，广泛应用于生物信息学领域，特别是在系统发育分析和功能基因组学研究中。它通过采用快速傅里叶变换（FFT）来提高比对的速度和准确性，适用于大规模数据集的处理。MAFFT提供了多种比...
...类报错，添加nopolish参数就可以运行，这一次添加完报错信息是：在输出文件时无法识别格式invalid record found in annovar outputfile:。是不是软件没有更新？annovar/2019Oct24/annotate_variation.pl 我用的是这一版。还是说有一些低质量没有过...
...数据标准化、WGCNA-加权基因共表达网络分析 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
...的参数是 -m 8 blast+对应的参数是-outfmt 6 更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深...
...OS路径）。 02-2：在登录页面选择“AK登录”，输入 所有信息 ，即可登录下载。 03：linux | 通过 命令行 登录 tosutil工具 下载数据 03-1：通过tosutil工具下载数据，同样需要数据所在账户的 Endpoint、Access Key ID、Secret Access Key...
...非常方便地确定某条rRNA基因序列从门到属/种水平的分类信息并给出各水平相应的置信度。 主页： http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp 2. SILVA 简介： SILVA一词起源于拉丁文silva（意为forest），它是一个包含三域微生物（...
...rue”是我查看了GATK官网后加上的，但是依然报错。 报错信息如下： 麻烦各位老师帮我解决一下，非常感谢！
...ash.py --version 如果说执行该条命令，能够输出Cogent的版本信息，那么安装就是成功的