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文章 COX 生存分析模型

...        4. 危险率(风险)函数 具有变量X,且生存时间达到  的观察对象在时刻 的瞬时死亡率,                                危险率函数  实际上是一个条件瞬间死亡率  。 基本原理 生存分析的主要...

文章 HMMER ——hmmsearch 用法,参数

...简单来说,hmmer是使用隐马尔可夫模型,在序列数据库中搜索同源序列,并进行序列比对的工具箱,拥有比blast更高的准确性和相同的速度。常用的Pfam数据库(经合并到interpro当中,只不过interpro下载之后是压缩文件,)提供hmmer...

文章 GSDS网站docker镜像本地构建

...的专门为GSDS定制的docker镜像 > docker search omicsclass   #搜索镜像NAME                           DESCRIPTION                                     STARS               OFFICIAL            AUTOMATEDomicsclass/gene-family         gen...

文章 你所不知道的,华为项目管理之道!

...因,在访问了一些员工之后得知:大部分项目经理在领导分配任务后,竟然不清楚自己应该在什么时间执行任务、什么时间完成、怎么去操作、具体完成到什么程度才算合格。这些人习惯于听到任务以后,什么都不考虑,召集几...

文章 天天加班,为什么团队研发效能还是那么低?

...及测试。CORNERSTONE的甘特图功能可方便管理者弄清项目的剩余时间,评估工作进度,调整工作任务,更好地把握项目的整体。 2.2 站立会、周会 每日站立会以及周会是保证项目正常进行的手段之一,通过每天的站立会沟通,...

文章 UALCAN--TCGA数据挖掘网站

...)。 目标基因深度挖掘 在经过数据的初步分析和相关筛选之后,针对筛选出的目标基因进行表达鉴定、biomarker的鉴定、生存分析等等。例如此处选择一个目标基因ANLN(多基因以“,”分隔) 进行演示,在输入框中输入ANLN,...

文章 组学大讲堂携手网易,所有线上课程折上折

2020年注定是不平凡的一年。从新冠疫情开始至今,近半年,各行各业都面临着巨大的压力。就我们生物圈来说,各高校及研究所还没有完全复学,样品无法正常准备,实验无法正常开展,我相信对于那些即将毕业的硕士、博...

文章 生物专业很惨?这位生物学家被诺奖提名155次,从未获奖!

...发中,其中生理学或医学奖、物理学奖、化学奖、文学奖经公布, 还剩下和平奖和经济科学奖2项没有公布, 对于学霸姐姐来说,最最关注的奖项都经都出炉了, 你们最关注的的是哪个奖项呢? 虽然诺贝尔奖每年都会...

文章 蛋白纯化的原理、操作及注意事项有哪些?

...程设计的关键。   在背景信息、检测方法和样品规格都到位的情况下,可以考虑采用三阶段纯化策略。纯化分为捕获、中度纯化和精细纯化三个阶段,每个阶段都有特定的目标。捕获阶段的目标是分离、浓缩和稳定目标产物...

文章 人源化抗体包含哪些?义翘抗体人源化服务简介

...达人-鼠嵌合抗体以来,基因工程抗体的研究发展迅速。有多种不同特异性的基因工程抗体经FDA批准进入临床使用,显示了良好的应用前景。   二、改型抗体   改型抗体也称CDR植入抗体(CDR grafting antibody),抗体可变区的CDR是...

文章 打破部门壁垒,提升跨部门协作效率,让沟通更加有效

...沟通完全没问题,但是跨部门沟通就问题不断;一项工作分配好由一个部门主导另一个部门协作,但因配合不当,迟迟无法交付;跨部门工作经常出现多个部门重复做了同一份工作;工作出现问题,各部门相互推卸责任,无人担...

文章 KM-plotter在线生存分析

...(譬如针对GEO数据库数据、TCGA数据库数据进行分析),筛选biomarker之后,再利用该网站对目标基因进行生存分析验证,从而佐证并丰富实验结果。 网站使用 KM-plotter的使用界面如下图(Ovarian Cancer界面),页面罗列了生存分...

文章 TWAS分析的原理和工具

...测量基因表达的研究受到样本可用性和成本的阻碍,少数发表的表达和复杂性状研究比单独研究性状要小几个数量级。因此,许多表达-性状关联无法检测到,尤其是那些影响较小的关联。为了减轻样本量小导致的功效降低,...

文章 这种机器学习算法经在微生物分析中成功应用

...。下面我们就来介绍这种算法的实现方式和应用(该分析加入组学生物微生物多样性项目分析内容套餐)。 算法简介 随机森林是一种基于决策树的高效机器学习算法,可以用于对样本进行分类,也可以用于回归分析。它属...

文章 25天破解“粮食杀手”草地贪夜蛾基因组

...一种害虫,主要为害玉米、水稻、甘蔗等重要经济作物,经造成了数十亿美元的经济损失,是全球预警的重大害虫,名副其实的“粮食杀手”。 我国也未能幸免于难,自2019年1月首次在境内被观测到至6月底,经在近20个省...