找到约 15 条结果

文章 group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件

当需要处理一个包含分组信息的数据框时： #创建示例数据df <- data.frame(  group = c("A", "A", "B", "B","C","C"),  value = c(1, 0, 1, 1, 0, 0)) 如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组，然后使用filt...

文章 快速高效KM生存曲线绘制-脚本使用

...及说明 初次使用脚本时，可以通过-h参数获得以下帮助信息。 Rscript km_plot.r -h usage: km_plot.r [-h] -m metadata [--surv_cut] [--median_cut] [-l] [-t time] [-s status] [-g group] [-n group_name] [-y ylab] [-H HEIGHT] [-W WIDTH] [-o outdir] ...

文章 国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”

...续一系列的分析目的，需要获得大熊猫和小熊猫的基因组信息。然而之前小熊猫还没有公开的基因组，而大熊猫的基因组由于公布比较早，质量也不够理想。 于是作者对小熊猫基因组进行了从头测序，组装大小2.34G，contig N50 98....

文章 TCGA-ceRNA网络构建

...结合实验数据，对靶位点进行验证，获得可靠的调控关系信息。 2. lncRNA与编码蛋白基因间的相关性： 基于ceRNA理论，竞争性的分子间存在着一定的协同相关性，可以基于分子间的相关性，对构建的ceRNA网络进行优化 如果...

文章 串联重复基因 tandem和segmental的区别与联系

...siology Aug 2016, 171 (4) 2294-2316; DOI: 10.1104/pp.16.00523 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 求大神指导如何安装Bio-linux系统，及在该系统下如何安装CG View及Orthmcl和OrthoFinder

各位好！         我因研究课题需要，要进行细菌生物信息学分析，但我不会Bio-linux系统安装及在该系统下安装其他生信分析软件，因此，来此求救，希望懂的人能帮忙指导一下,能语音指导的话最好了，我实在是一点生信背景...

文章 CAR-T质量检测ELISA试剂盒常见问题解析

...r值为0.9，做了多次都是这样，怎么办？   答：要仔细核对产品说明书，看是否用了推荐的拟合方法，如爱必信的ELISA试剂盒，需要使用四参数拟合方式进行拟合，用错拟合方式，会导致r方值较低；如拟合方式无误，需检查是...

文章 dellBIOS 更新

...S_LX_[版本].BIN --version”命令，然后仔细阅读所显示的发布信息。 2. 下载并安装上述步骤中标识的任何必备项，然后再继续。 3. 进行此 BIOS 更新之前，安装所有必需的嵌入式系统管理固件。 4. 从 shell 执行“./[型号]_BIOS_LX_[版本...

文章 cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

...物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起，其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。 通过Cytoscape，可以在可视化的环境下将这些生物网络跟基...

文章 NCBI 基因组文件下载——datasets

...06505.1 --include  genome,gff3 --filename GCA_027406505.1.zip 3. 帮助信息 ./datasets --helpData Retrieval Commands  summary     Print a data report containing gene, genome or virus metadata  download    Download a gene, genome or virus dataset as a zip file 下载的结果是：ncbi_...

文章 误差线该用标准差还是标准误？

...pe与网络图绘制课程、R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

问题 关于动植物基因组组装课程中关于重复序列注释的问题

...对保守domain进行鉴定，再用DeepTE.py借助上一步的保守domain信息分类TE。课程中没有对保守结构域进行鉴定，直接进行TE分类，原因是什么？没有必要？ 175行截图： https://www.jianshu.com/p/85e54962e2bc：网页截图 2、第99行和第204行的区...

文章 疫情当下，“云办公”在国外会面临什么样的问题和挑战

...作得不到进行。苹果在生产协调上已经陷入困局。 2、信息安全 很多互联网软件服务企业，相关的重要数据都只能在内网中获取，但是如今在家办公，导致公司迫不得已必须开放部分数据权限，但是，对于苹果来说，涉及到...

文章 deepseek绘图之--FPKM小提琴图

...文本文件，第一列是基因名称，后序列是所有样本表达量信息；第一行是样品名称，后续行是基因在不同样品表达量信息） 使用R语言绘制小提琴图，对表达量取对数 图形类型：小提琴图 主题：隐藏网格线 ------------------------...

问题 使用get_gene_length_from_gtf.py脚本统计基因长度时报错

...python脚本统计，都是教程上的步骤，然后就报错了 报错信息如下 Traceback (most recent call last):   File "../script_new/get_gene_length_from_gtf.py", line 48, in <module>     kvs=get_value(tmp[8])   File "../script_new/get_gene_length_from_gtf.py", line 36, in g...