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问题 老师,从原版上或者你的改进版上下或者安装qtlseq的时候,用conda创建环境安装的时候,怎么分别安装到两个人的版本

如果我利用下面的安装,我安装的是黄老师的,还是原来的那个人的?怎么分别?或者怎么安装到两个版本

文章 组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

...学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像(v1.4)使用的qiime2 版本为:Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8,相较于2020.8版本有很多大的更新,更新信息如下: 扩增子docker镜像更新说明 为使大家使用上最新的qiime2软件,我...

文章 trinity的下与安装

...规模的RNA-seq的reads数据。 trinity的下与安装 trinity最新版本是v2.8.5官网在:https://github.com/trinityrnaseq/trinityrnaseq/wiki 解压:tar -zxvf Trinity-v2.8.5.tar.gz cd trinityrnaseq-Trinity-v2.8.5 编译:make注意:trinity需要3.1以上版本的CMake ,记...

问题 老师,您好,我做基因家族分析时绘制表达模式热图,因为我的GFF3文件是从ensemble上下的,发现从NCBI上下的转录组数据的基因ID与我的基因ID一致,这时该怎么判断那个是同一个基因呢?

这个是NCBI中转录组数据中的ID 这个是我的基因ID

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

...r QuickStart 图标来启动 Docker Toolbox 终端。 首次安装,会在线boot2docker.iso到:c:\Users\Administrator\.docker\machine\cache\  :注意:如果点击Docker QuickStart 这个路径可能存在,所以一定要运行一下Docker QuickStart 让他下文件并创...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...界面如下: IBS的下 IBS可以下到本地使用,也可以在线使用,两者主要差别是下版有35个蛋白样品图和27个核酸样品图,在线版只有20个蛋白样品图和20个核酸样品图。如下图,点击主菜单栏download,IBS已经更新了4个版本...

文章 必须收藏!比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

...发一款用于多物种全基因组直系同源基因簇比较和注释的在线工具—OrthoVenn2,非常简单好用! OrthoVenn2简介 OrthoVenn2 是由西南大学生物学研究中心王翊教授开发,较之前版本OrthoVenn v 1.0版本,OrthoVenn2的性能、数据库、分析及结...

文章 推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具!

...击链接查看吧!今天我再为大家介绍一个绘制基因结构的在线小工具:Exon-Intron Graphic Maker。它可以根据序列长度等比例绘制基因的结构元件,如5' UTR、CDS、外显子、内含子、突变位点、结构域、3' UTR等。下面,我们一起来了解...

文章 linux中查找包含指定内容的文件

...   -r 递归查找文件     -e 从文件内容查找与正则表达式匹配的行     –i 查时区分大小写     -c 查找匹配的行数     -v 从文件内容查找匹配指定字符串的行 从根目录开始查找所有扩展名为.log的文本文件,并找出包...

文章 linux命令之AWK

...代码,主要是引用全局变量,设置FS分隔符//           匹配代码块,可以是字符串或正则表达式{}           命令代码块,包含一条或多条命令;          多条命令使用分号分隔END      结尾代码块,在对每一行进行处理之...

文章 GOrilla-一个在线GO富集分析的网站

给大家推荐一个进行在线GO富集分析的网站 GOrilla: http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/   可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。 1、第一步是选定物种,下拉列表中的物种涉及了以下几种: Arabidopsis thaliana            ...

文章 关于miRNA你知道多少?

...泛,受物种限制,同时提供windows,linux,和macintosh多平台版本,可以下到本地运行。 三、miRNA名称与编号 1) miRNA成熟体命名规则(以动物miRNA为例)  ①确定命名规则之前发现的miRNA,则保留原来名字,如hsa-let-7。 ②miRNA成熟...

文章 收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解

...)是一个能对基因或蛋白质列表进行注释和富集等分析在线工具,除了传统的GO注释和富集之外还提供的蛋白质互作分析结果,网站基本维持每月更新,确保分析结果及时准确,而用户只需要输入需要分析的基因列表即可完成...

文章 linux命令之sed

...式  sed 的正则表达式元字符 元字符功 能示 例示例的匹配对象^行首定位符/^love/匹配所有以 love 开头的行$行尾定位符/love$/匹配所有以 love 结尾的行.匹配除换行外的单个字符/l..e/匹配包含字符 l、后跟两个任意字符、再跟...

文章 KM-plotter在线生存分析

KM-plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=service) 是一个在线进行生存分析的网站。目前网站可以针对54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究,涉及了乳腺癌、肺癌等等;数据类型有芯片数据、高通量测序数据,涉及mRNA和miRNA,并...