... 列表是标量的有序集。数组是包含列表的变量。在Perl 中这个两个术语是可以互换的。但严格意义上讲，列表是指数据，而数组是其变量名。可以有一些值(列表)但不属于数组；但每一个数组标量都有一个列表，虽然其可以为空...
为什么我没改这个基因组名字为自己物种好像也没有啥影响？ 说到影响就是 是不是会影响后面的命令的运行？ #将基因组序列文件和注释文件批量链接到当前文件夹 cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ....
...越来越普及，诸如微阵列杂交和基因表系列分析（SAGE）可以同时测量数以万计的基因转录脚本（gene transcript）。基因表达大棚车（GEO：Gene Expression Omnibus）则是归档和自由分发科研人员提交的高通量基因表达数据的公共仓库。目...
...只需要在对应的位置输入基因或者蛋白列表（见下图），可以直接粘贴也可以导入列表文件，并且网站页面给出了各种案例文件的格式。目前网站接受多种形式的id，包括Entrez Gene ID，RefSeq (RNA and Proteins)， Gene Symbol and aliases，Ense...
...别，年龄等基本信息。 2. 进行生存分析 这里根据性别这个二分类变量，采用KM算法来估计生存曲线，代码如下(summary结果只显示部分） > library("survival") > library("survminer") > kmfit<-survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung) > ...
...据库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下载，但是用这个方法下载数据需要经过复杂的设置，而且经常莫名奇妙的下不了，总的来说体验很差。 其实老朋友迅雷也是可以下载的 下面通过一个例子介绍如何用迅雷下载SRA数...
...整个蛋白复合物从溶液中“拉”下来，进而可以用于鉴定这个蛋白复合物中的其他未知成员，或者是鉴定两种蛋白是否互作。免疫共沉淀的特点可以概括为两点，第一是天然状态，第二是蛋白复合物。免疫共沉淀鉴定的相互作用...
...没有重复这种。当然也没有可关联的临床特征。如图，我这个绿色模块，根据模块向量特征热图，H处理之后，它的模块向量特征在每一个细胞系都减少。这个模块算不算有意义？可不可以认为这个模块的基因与H因素处理关系密...
...对于其他行直接输出 print(line.strip()) 这个脚本可以完成如下任务： 1.读取输入文件（gff文件）； 2.对于每一行，根据第3列的内容（gene/mRNA/CDS/exon等），分别进行处理： 对于...
...那个不负责任的销售吧，十有八九是忘了把结果给你了。这个情况还真不是小编杜撰，我起码碰到过两次，老师项目都做完2个多月了，钱也结清了，结果手里就一个结题报告。 结果文件夹内容概述 下面我们具体讲讲这10个文...
...行，spark用于在spark集群上运行。实际使用时，直接用gatk这个可执行文件就行了。通过一个简单的命令，查看程序是否正确安装gatk —list这个命令能够打印出所有的子命令，如果打印出来结果，说明程序安装正确。部分子命令截...
...异信息 例如，SNP信息2、在大部分情况下，我并不知道这个群体实际包含几个亚群。我们把群体的亚群数称为K值。那么我可以预设群体亚群数等于1~n，即K=1~n。那么软件就会模拟在K=x的情况下，使用贝叶斯算法推算群体是如何...
...可能可以灵活放手单人，但面对复杂的挡拆就毫无办法，这个时候就需要“管理”的意识，打一些全局联防，花一些时间来梳理，有章法去做事，才不至于失败。 二、我要讲什么？ 当然每个团队的问题、氛围、规则制度都...
...因子的研究方法供各位老师参考，有不到之处或不同观点可以随时沟通讨论。 1.什么是转录因子 转录因子（Transcriptionfactor，TF）的调控决定着基因的调控网络以及表达水平。基因的表达驱动着一系列的细胞活动，这些表达的调...