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文章 SNP2CAPS使用

...hr5D:9950377.fa_1为SNP两端各150bp的序列;link_gcg限制性内切酶数据库;之后为分析用到的限制性内切酶列表 ;chr5D:9950377.txt为输出文件 chr5D:9950377.fa_1示例: >chr5D:9950377_Ref ACAACTTTATCTCGTATTTCATAGCAGTAGCCAACCAATCTTATGATATTTTGATGTTGGGCCCTCATAAGATTC...

文章 绘制类似于箱线图的散点图

...pec) }if ( is.null(opt$name) ){ opt$name = "Co-occurrence_network" }#读入数据point1 <- read.table(opt$input1,sep="\t",header = TRUE,comment.char = "")point2 <- read.table(opt$input2,sep="\t",header = TRUE,comment.char = "")#分别取中位数median1 = median(point1$log2FC, na.rm = FALSE)me...

文章 2019年国自然结果分析,生命科学领域难度又又又增加了吗?

... 当然,很多同志们还是跪了。。 一起来看看今年的总数据分析: 今年全国共有1400多家单位申报的项目获得立项,立项总数超42000项, 不过绝大多数单位获批项目数少于50项。 上海交通大学依然高居第一! 不得不说,上海...

文章 生物专业由冷转热?你还敢选生物专业吗?

... 各国政府都在大力支持生物行业,科技设备的发展、大数据的合理应用更加推进了生物行业的稳健发展。 生物行业的前景还真是印证了那句话:21世纪是生物的世纪。 那么,生物专业的就业怎么就那么差? 想当年,学霸姐...

文章 博士生存现状:被延期、被退学、抑郁自杀、Science“官方劝退”

...疑人生学业的压力,让很多博士被“延期毕业”,之前有数据统计,博士被延毕的十之八九,粗略可见端倪,另外,这周还有一个新闻就是:某博士在顶会召开前9天,终结了自己的生命。都中了顶会,反而还做出了这种选择,...

文章 泛基因组可视化

...个工具是一个网页工具,默认端口是3000;先把要展示的数据文件链接到他的安装目录中的exampleData中,再启动服务就可以可视化查看感兴趣的位点了:# 链接文件过去到这个文件夹: cd /share/work/biosoft/sequenceTubeMap/sequenceTubeMap/exam...

文章 2019国家杰青名单公布,北大最多!透露的信息还有......

...科研机构, 而对于没有“师出名门”的平台,还是看看数据就好。。。 所谓“僧多肉少”就是这个意思。 2019国自然杰青名单分析:北大最多,中科院系统抢眼 从公布的名单来看,主要透露以下信息: 1,高校中,北京大学...

问题 基因家族分析时用大豆gff文件报错 killed

老师您好,我在进行大豆基因家族鉴定时,数据准备过程中想要进行“保留蛋白编码基因”出现报错“=> Version of the Bioperl GFF parser selected by AGAT: 3 gff3 reader error level1: No ID attribute found @ for the feature: 1    ena_assembly_gap        bi...

文章 读博的目的,就是为了进高校当老师?真相是——

...。 大学老师的收入高吗? 学霸姐姐在网上也看了一些数据, 一个985/211的博士生刚工作,如果是在一个普通高校当讲师,大概年薪在8-15W之间, 有少量的安家费和科研启动资金,不会很高, 压力还特别大,为了评上副教授...

文章 探讨敏捷开发在软件开发中的应用

...搞定后,再进行概要设计(UE设计、UI设计、交互设计、数据库设计、框架设计),概要设计完成后再进行详细设计……这样一个周期下来,耗费太长,当进度进入下一阶段,当上一阶段有问题时,会影响到整个项目流程的各个...

文章 泛基因组视频课程介绍

...组(graph-based assembly)。 迭代组装指将多个样本的下机数据比对到一个参考基因组后,将未比对上的reads组装成新的contigs。通过将这些新的contigs添加到原始的参考序列中,就可以构建一个泛基因组;多个体De novo即对多个样本同...

文章 linux下samtools安装指南

...与已知序列信息的基因或基因组进行比对)是高通量测序数据分析中最重要的一环,无论是转录组还是重测序都是基于比对结果来进行后续各项分析的,比对结果格式比较常见的是sam和bam文件,例如转录组Tophat分析软件输出的比...

文章 Nature | 获得学术成功的3个技巧——享受社交生活很重要!

...此类活动。因为你的大脑需要休息,在分析了三个小时的数据之后,你的大脑会不再清晰思考,并开始犯错,这个时候站起来去活动一下,工作会更高效。通往成功的道路上不只是苦,还有甜古话说“吃得苦中苦,方得人上人”...

文章 地球上物种总数到底有多少??

...个地点的真细菌、古细菌和微小真菌的20376项调查获得的数据汇集在一起,使用比例定律(scaling law)和一种生物多样性模型的混合分析方法对微生物总数进行了预估,结论是地球上的微生物物种总数约为 100000000000~1000000000000之...

文章 科研小白:生物实验做不出来是种什么体验?

...ts lift the lid on reproducibility”的文章, 文章中公布的一项数据让学霸姐姐“豁然开朗”: 超过70%的科研工作者,在尝试重复另一位科学家的实验时以失败告终; 超过50%的研究人员未能复制自己的实验。 你看,这不是很正常嘛...