...的细胞死亡，因此细胞的浓度应足够高，起始浓度106—107个/ml/管; 四、细胞的传代培养 细胞传代：细胞在培养过程中不断增殖，培养皿/瓶空间有限，当细胞接触过密，生长就会受到抑制，影响细胞状态，因此我们要把其中一...
...样：${var}ing sh中$(ls) 2.转义字符 \t 表示tab空白 \n 表示换行符 3. \ 的作用 作用：转义字符 取消字符含义： 取消$的变量标识 print "the \$var is $var \n"; 取消双引号" print "A quote \" in...
...网站有时候打不开，可能服务器没有人维护，原网站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php 备用网站：http://gsds.gao-lab.org/index.php 这里为了方便大家使用GSDS，绘制基因结构图，组学大讲堂免费提供一个镜像使大家可以在自己的电脑...
...们直观展示基因的外显子-内含子结构；定位突变位点、SNP位点在基因中的位置；展示不同转录本的结构差异。ggbio是基于ggplot2开发的基因组数据可视化专精包，特别适合处理基因组坐标数据。它够直接处理GRanges对象（基因组范...
“ 2025年5月 BMC Plant Biology杂志发表了一篇题为“Transcriptome and metabolome analysis of senescent rice (Oryza sativa L.) seeds: insights into the mechanism of germination vigor and seedling morphogenesis”的转录组代谢组联合分析文章。” 01 — 研究背景 种...
...提供了Windows版的ossutil软件，但数据量很大的时候例如100G+，用windows软件下载就太慢了。 这个软件也提供了Linux版，使用它在Linux上下载阿里云数据非常方便， 一、软件下载 软件下载地址：安装ossutil (aliyun.com) 如果有sudo权限...
...使用reshape2包将宽型数据转换成长型数据，反之亦然。这个包也是由Hadley Wickham开发和维护的。 升级包 tidyr：https://www.omicsclass.com/article/1475 长数据 vs 宽数据 对于宽型数据，每列代表一个不同的变量。例如datasets包中的mtcars数...
...些大家在使用docker工具分析数据是的高级用法，方便大家更好的使用docker工具。 问题1：有时候我们运行一条命令可能需要很长时间，在这个过程中无意间关闭了终端，我的任务还在运行吗？还可以继续吗？ 答：我们的任务还...
扩增子分析视频课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF 微生物多样性分析中最重要的就是OTU特征表，一切后续分析都围绕OTU表来进行。生成OTU除了聚类的方法，还有降噪的方法。本文分析DADA2、Deblur、Unoise3共三种降噪方法的...
老师您好！我在使用gatks生成gvcf文件时，报错，想麻烦老师帮忙看看是什么原因导致的呢？命令：/opt/biosoft/gatk-4.4.0.0/gatk HaplotypeCaller -R genome.fasta -I LSL1.MD.bam -ERC GVCF -O LSL1_test.g.vcf --pcr-indel-model CONSERVATIVE --sample-ploidy 2 --min-base-qual...
...分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队，克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……，还有数以千计的硕博论文。基因定位的传统方法是使用人工分离群体进行QTL定位，我们在本文中重温一下分离群体（作图群体）的一些概念。 ...
更好的阅读体验： https://mp.weixin.qq.com/s/jdBpM_cFBZLZtjtHUTl-8w iTOL（https://itol.embl.de/）是一款很好的进化树美化软件，但是他的配置文件制作非常麻烦，给大家的使用带来了不便，这里介绍一个工具帮助大家可以从表格文件中快速生...
杂交瘤技术是一种将B淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合生产单克隆抗体的传统方法。该技术通过将动物脾细胞与骨髓瘤细胞融合，产生永生化杂交瘤细胞系，然后筛选其上清液中的抗原特异性克隆，并进一步循环亚克隆以产生严格的...
我想很多人应该对这个新闻还记忆犹新：2016 年 7 月，Nature 报道了这一新闻：四川大学华西医院卢铀教授研究小组计划利用 CRISPR 技术编辑的T细胞（敲除 PD-1 基因）治疗转移性非小细胞肺癌患者。 全球首例，国际领先，一时...
这是我运行的命令 vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-INFO-all --stdout \ --maf 0.05 --max-missing 0.7 --minDP 4 --maxDP 1000 \ --minQ 30 --minGQ 80 --min-alleles 2 --max-alleles 2 |gzip - > all.clean.vcf.gz 这是我的报错 sing zlib versio...