具体报错信息如下： NOTICE: Running with system command <coding_change.pl ./indel_AT899.refGene.exonic_variant_function.orig /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGene.txt /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGeneMrna.fa -alltranscript -out ./indel_AT899.refGene.fa -newevf ....
... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...小RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步： 1. 测序数据与宿主基因组进行比对，过滤掉来源于宿主的序列 2. 没有比对上的序列，进行denovo 组装 3. denovo 的序列与已知的病毒库进行比对，找到相似度高的病毒序列 VirusDetec...
...然。 4. 与NCBI序列比对 APE软件还可以将序列直接与NCBI数据库中序列进行比对，选中要比对的序列，点击Tool工具中BLAST sequence at NCBI，软件自动打开NCBI比对页面，如下： 5. sgRNA辅助设计 选中序列后，点击Tool中sgRNA，APE便会...
我从EBI下载了一份单芯片表达数据，我照着NCBI下载的Annotation文件自己做了一份fData。 在chip-deg5的载入数据步骤显示如下问题： Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : 'row.names'里不能有重复的名字 ...
... 1. 毛竹中bHLH基因家族基因的鉴定 作者利用毛竹基因组数据，根据Pfam数据库中Hidden Markov Model (HMM)，一共鉴定到137个bHLH基因候选基因。 2. 构建系统发育树和bHLH家族基因选择压力分析（Ka/Ks计算） 作者选择拟南芥144个, 作者选...
...gff <- opt$gff # gff文件pheno <- opt$pheno # 表型数据group <- opt$group # 样本分组信息Chr <- opt$chr # 基因所处的染色体名称start <- opt$start # 基因的起始位置（染色体坐标）end <- opt$end # 基因的...
老师，您好。我在利用hifi + ONT + Hi-C 数据进行基因组组装时，发现有3~4条染色体的一端并没有组装到端粒，想问一下，有什么类型软件可以利用测序数据进行一个端粒的延伸，让这几条染色体达到T2T的水平？
...是这样的，在进行单倍型分析的时候，利用教程给的demo数据，按照w.sh中的代码一步步操作，能正常分析，非常丝滑，但是我只要换成自己的数据，就会报错“Error in data.frame(Hap = haps, Type = infos) : arguments imply differing number of rows: 1...
...于展示集合（sets）之间的交集关系，特别适合于高维度数据中多重集合交集的可视化。它是传统Venn图和集合图的替代方案，特别在集合数量较多或交集较复杂时，更加清晰和实用。Upset图的应用广泛，常见于生物信息学、统计...
...理后借助液相色谱质谱仪（LS-MS）检测不同样本中代谢物数据信息。LS-MS共检测到18166种代谢物。最后注释到7670种代谢物。之后对代谢物进行聚类分析和PCA分析。（图ac为正离子模式下检测到的代谢物、图bd为负离子模式下检测到...