找到约 15 条结果

文章 最新2区SCI思路解析—杨树TPS/TPP基因家族的系统分析

...tTPP家族在不同组织及不同环境下的表达情况作者从NCBI-GEO数据库下载的杨树不同组织及不同环境下的基因表达数据,分析了PtTPS和PtTPP家族成员在不同组织(叶、茎尖、根)及不同处理下(水杨酸、茉莉酸甲酯处理,干旱处理)...

文章 论文查重?给你推荐几个好用的网站!

...CrossCheck反剽窃检测系统的技术支持、检测能力以及比对数据库基本一致。 Turnitin检测相似性的原理不同于中文字数的重复检测原理,它监测的是句子语法逻辑,与单词重复及其重复字数是没有直接关系的,知道这些我们就可以...

问题 在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时,对不能用转录组数据比对回去的基因进行PCR验证,因为我不是学生物的,对PCR不了解,想问一下它是对那段基因的DNA进行扩增的吗?那段DNA是可以根据预测的序列人工制造出来吗?PCR扩增什么时候可以扩增出来什么时候扩增不出来呢?怎么就能验证基因的是否真的存在呢?

问题 在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时,对不能用转录组数据比对回去的基因进行PCR验证,因为我不是学生物的,对PCR不了解,想问一下它是对那段基因的DNA进行扩增的吗?那段DNA是可以根据预测的序列人工制造出来吗?PCR扩增什么时候可以扩增出来什么时候扩增不出来呢?怎么就能验证基因的是否真的存在呢?

问题 老师,我在做泛基因列表时,提取最长转录本都成功提取,但其中一个基因组一直无法提取cds,后来查看提取出的转录本格式一样,但有些内容可能与其他基因组不一样(下载数据时,这个基因组格式是gff3,其他为gff,提取最长转录本时我把他改为了gff),您那边是否可以帮忙修改这个基因组的gff文件,

文章 SCI文章投稿各阶段的电子邮件模板合集

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 关于操作中遇到的Perl脚本。

  我想请问,按照视频里的操作方法一切数据的提取都是通过给定的Perl脚本来实现的。但是你们提供的脚本总会有局限性吧!如果非要完成特定的需求。那么请问如果实现不了的数据提取操作能否用python来写出一个相应的脚本...

文章 推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具!

...基因结构的准确信息,基因结构信息可以来自文献、各种数据库、GFF基因组注释文件等。例如,ensembl数据库中拟南芥WRKY基因,以转录组本AT1G66550.1为例;该基因共765bp,254个氨基酸,并且有基因结构的准确信息。 具体做法如...

问题 线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么?

我正在用ont数据组装植物线粒体,我想知道11.smartdenovo.sh中组装完成后挑选contigs的标准是什么?ont数据在组装前需要校正吗?

文章 简单实验+蛋白质组=4分文章, So Easy!

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 进化树+motif+基因结构三个一起显示报错

老师好,这一步上课时老师没有演示,所以我在操作时一直出现错误。包括我用了demo里的数据也是报错。用的demo数据分别是:03文件夹.iqtree2.pep.fullLength;04文件夹meme.xml;05文件夹gene_exon_info.gff

文章 微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

...主要更新内容如下: 使用最流行的工具qiime2分析扩增子数据使用主流的基于降噪的方法生成feature-table,同时也兼容基于聚类的方法生成OTU table(内存限制)物种分类注释数据库更新到最新,silva(138),greengene(2022_10),ITS(ver9)物种...

文章 必须收藏!比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

...授开发,较之前版本OrthoVenn v 1.0版本,OrthoVenn2的性能、数据库、分析及结果展示方面都有很大的提升;OrthoVenn2基于OrthoMCL启发式匹配算法,用DIAMOND进行比对,比传统的BLAST算法速度提高了1万倍,OrthoVenn2基因组蛋白序列来源于Ens...

问题 如何整理茶树的KEGG代谢物背景库

我想用metaboanalyst平台处理我的代谢组数据,在做KEEG富集这步,需要提交茶树代谢物背景库,示例如图。 如何将KEGG网站(https://www.genome.jp/brite/htext=csin00001.keg&query=csin00010)上的数据转换成这样的格式,如何快速进行手工...

问题 宏基因组 2 3 代一起组装注释

五个样本,二三代各有数据数据大小15g左右  目标是完成二三代联合组装,分箱MAGs,基于组装草图 ,MAGs 的双维度物种注释,微生物丰度量化,功能注释,最终输出标准化结果,交付内容基于分箱和组装的物种注释,丰度表...