...夹下的gmes.log有显示error，但是没提醒具体的问题。请问如何解决？是用的docker运行genomic-annotation这个镜像
...个界面，有不同组装完整的筛选，系统会自动为我们筛选比较好的基因组，一般来说我们选择level这一列中，测序水平最高的一组。就是黑色部分占据面积最多的哈~(比如下面)，size最大的一个就可以，点击Assembly列链接： ...
...状态，由于数据都存放于内存中，所以不占用磁盘空间，比较重要的目录有/proc/cpuinfo、/proc/interrupts、/proc/dma、/proc/ioports、/proc/net/*等。/root：系统管理员root的宿主目录，系统第一个启动的分区为/，所以最好将/root和/放置在一个...
请问R/QTL这个包可以用来做果树群体的qtl定位吗？如果可以的话，基因型该如何分型
...照染色体分的，一共22个常染色体22个bam文件，那么他们如何作为输入文件写进代码里面呢？我看代码输入文件是一个bam文件，我是需要把bam文件进行 samtools merge吗？
老师您好，我在进行GTDB注释时，根据课程所给的代码下载了GTDB的数据库信息，但进行注释时，却出现了缺少参考基因组的信息，具体情况见下图。请问该如何解决？
如何将这行命令 perl bin/indel_p3in.pl QT4indels2.in genome.fa con.txt，写成一个shell脚本即*.sh的形式
...低强度的信号点，刮擦的痕迹，背景太高等等，整个图像比较均一，背景均一。 基于affy包中的image()函数，对AffyBatch对象直接可以绘制出每一个样本芯片的灰度图， 以GSE66196数据为例，绘制第一个样本灰度图。 image(AffyBatch[,1])...
...itute，JGI）于2005年创立，是综合的微生物基因组数据库及比较分析系统。IMG收录了细菌、古菌、质粒、病毒以及少量真核生物基因组数据，其数据主要来源于NCBI的RefSeq数据库，但是增添了更加详细的注释信息，例如CRISPR序列、...
...发现芯片文件（GPL.soft）中这些ID都很生僻（如图）,不知如何转换成传统ID？ 貌似那个TIGR ID已经绝版了？我在TIGR ID的对应网站无法下载到对应的转换文件（http://maize.jcvi.org/）。 请问怎么办？ 谢谢！ 注：这是该数据库涉及...
...cut -d "(" -f1 > ko-gene 4. 和我们的基因-KO编号list文件进行比较 cut -d "|" -f1 KOlist | sed "s/\t/ /g" > kegg.kocat ko |while read -r line; do if grep -q " [[:space:]]*$line$" kegg.ko ; then echo "$line";else echo "false" ;fi ;done > result result文件里面如果...
...0，用的是自己的数据，前一步都还正常，不知道popid.txt如何设置，这里是按照示例文件，放了所有样品的集合，但是跑出来是如下这样 the Number of subPop samples[found in VCF] is 0 sub Group Population szie is too small, SubGroup sample size: 0 ##begi...
老师您好，我做有参转录组的基因ID与现在做基因家族鉴定的基因ID不一致，后续做基因家族成员转录表达模式分析的时候如何将基因ID一致化？
...建树，基因家族的鉴定是不是就不完整了？不删除的话，如何建树？
文章简单介绍一下perl中如何随机抽取数组中的一个元素。 这里用到List::Util模块中的shuffle子程序，List::Util模块是Perl中专门用于处理列表数据的一个模块。 方法如下： use List::Util qw(shuffle);my @shuffled_nums = shuffle(1..10); # ...