进行GTDB注释时报错，报错信息为缺少参考基因组

老师您好，我在进行GTDB注释时，根据课程所给的代码下载了GTDB的数据库信息，但进行注释时，却出现了缺少参考基因组的信息，具体情况见下图。请问该如何解决？

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2 个回答

大言子 2025-07-31 14:24

老师，按照您的方法进行了操作，但是镜像在使用中无法删除，麻烦老师再帮忙看下

xun - 电路元件工程师 2025-07-31 16:51

你输一下 gtdbtk -h

[root@d32fce929ab9 16:13:03 /work]# gtdbtk -h

...::: GTDB-Tk v2.4.1 :::...

看看出来的是不是这个版本,

我怀疑你没有加载上这个镜像,可以先把原来的镜像删掉的