...。 事实上，并不是这两个团队之间的协作帮助交付了更好的软件，而是“开发”和“运维”团队之间的统一导致了软件的改进，并以更快的速度交付。我们不要忘记DevOps工具在实现自动化方面所扮演的角色。 开发和运维...
...活动从策划、执行到复盘跟进等全流程的管理，帮助团队更好的规划营销活动。 方案策划及头脑风暴 在CORNERSTONE讨论模块里，针对有争议的话题，可以创建讨论话题，并各自说明自己的观点，也可在WIKI模块里的思维导图中共...
... 整型、浮点型、布尔型、复数型整型：1；2浮点型：a=1.1;b=2.3布尔型：True;False复数型：e=1+1j 2、查看类型 令a=1dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1等于a=a-a5、列表li=[1,2,3,4,5]litype(li) 6、元组 tu=(1,2,3)或tu=1,2,...
老师您好，在做基因组注释时，PASA_assembly中，seqclean报错，使用的是docker的镜像，已添加export USER='me' 报错信息如下： /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options: seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec Standard l...
...库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下载，但是用这个方法下载数据需要经过复杂的设置，而且经常莫名奇妙的下不了，总的来说体验很差。 其实老朋友迅雷也是可以下载的 下面通过一个例子介绍如何用迅雷下载SRA数据...
国际上著名的综合生物数据库有三个，分别为NCBI，ENA，DDBJ ，高通量测序的数据往往会提交到这些数据库，下面分别介绍一下： NCBI|Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ；NCBI是由美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnolog...
...种方法虽然可以提供整体的基因表达图谱，但无法解析单个细胞的特异 性基因表达情况。 Single cell RNA sequencing (scRNAseq):空转转录组测序技术的发展，使得研究人员能够对单个细胞的基因表达情 况进行测量。通过这种方法，可以...
...论文，分享给大家欣赏：1，最有“脾气”的论文标题《p’》对的，你没有看错，就是一个字母——P’，P’是穿透内核的地震波的缩写形式，这篇论文是丹麦的女学者莱曼于1936年发表的，这篇具有划时代意义的论文，在那个计...
在你们服务器上运行xpclr 软件的时候，找不到这个软件，相关的镜像已经下载。 [us002@omicsclass-a02 12:28:18 ~/work/pop_cucu_demo/05.select_sweep/xpclr]$cd $workdir/05.select_sweepmkdir xpclrcd xpclr## xpclr软件每次只能运行1个染色体## 原始的XPCLR分析...
...借助plot()函数： 默认画法 > plot(list$tree_row) 而有一个有趣的函数rect.hclust()可以将hclust结果绘图，并圈选出不同的cluster，譬如设定3个cluser: > rect.hclust(list$tree_row,k=3) 得到如下结果： 2、而将hclust结果转换成另类树形图a...
...红色，下调基因显示为绿色。具体方法是在第三列插入一个“if”函数，当第二列值为“up”时输出“red”，否则输出“green”，参数设置详见下图： 这样C2单元格就会显示为“red”，双击该单元格右下角，这样C列就都按上面...
...isat2-build genome.fa genome.fa#双端read比对hisat2 --new-summary -p 10 -x genome.fa -1 1.fastq.gz -2 2.fastq.gz -S rnaseq.sam#单端read比对hisat2 --new-summary -p 10 -x genome.fa -U rnaseq.fastq.gz -S rnaseq.sam#排序并生成bam文件samtools sort -o rnaseq.bam rnaseq.s...
....ALLHiC2/sample.bwa_mem.bam'。但该地址下是有该文件的。 第二个问题是ALLHIC1时形成了sample.clean.counts_GATC.13g1.txt、sample.clean.counts_GATC.13g2.txt、sample.clean.counts_GATC.13g3.txt，然后就中断，没有继续形成，染色体数目是设置了13. 第三个报...
REPuter可注释细胞器如线粒体或叶绿体的散在重复序列(Dispersed repeat)，包括4种类型，正向 Forward（F)，反向 Reverse (R)，互补 Complement (C)，回文Palindromic (P)。 REPuter 是在线注释的网站， 详情可参考文献 REPuter: the manifold applications ...
...量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 以转录组为例，想要挖掘数据，首先要看得懂数据，这是基础。 接下来小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣的基因等信息。...