T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图 - 组学大讲堂问答社区

T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf

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分类：基因组学

最佳答案 1天前

因为你nohup这个命令，但是没有把这个命令写成sh的脚本去运行，这样log文件会输出到你的结果文件里面。命令写成sh文件，再提交运行。得到新得结果。

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Ti Amo

采纳率 6% | 回答于 1天前

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青春无悔提出于 2天前