4106 个回答
0 赞同
0 赞同
0 赞同
为什么我hifiasm组装出来的文件基本都是空的呢？
hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装，你的ONT的数据错误率高 组装不出来；
回答于 2024-04-16 09:00
0 赞同
0 赞同
运行 ParaAT 多序列比对 出现报错
这里有基因ID，你找到对应ID的cds和蛋白序列检查他们之间是不是3倍关系；确认解决一下； 如果数量不多，可以把这样的基因对删除
回答于 2024-04-15 18:32
0 赞同
0 赞同
如何确定选择分析中的窗口和步长？
窗口和步长没有固定的，你可以根据基因组大小，平均连锁距离来合理设置； 基因组大可以适当加大窗口长度，L D连锁大也可以加大窗口； 也可以多试试几组数据，看看哪个效果好用哪个了；
回答于 2024-04-15 18:29
0 赞同
0 赞同
在进行全基因评估后，出图不正确，同时在进行hifiasm三代组装的...
你的genomescope 评估基因组，图很奇怪，可能是测序的数据量不够导致，一般建议基因组测序50X以上评估；数据量太少评估不准确，你看看你的数据量相对基因组是否足够； 组装抱错，这个就抱错信息可能是时间久服务器断开了，组装时间比较久，建议你把任务转后台运行吧；
回答于 2024-04-15 12:34
1 赞同