omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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请问重测序可以得到某物种的全基因组序列吗，能不能从重测序数据...

重测序数据理论上是可以的，变异信息就行你的菌株和参考基因组的差异，你把想要基因序列的差异替换一下就得到自己的菌株的序列了；

回答于 2024-05-06 09:19

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不要上传文件，直接截图；如果你觉得你的contig组装有很多错误，你可以选择打断再挂载；共线性不好这个不好说，可能是你的基因组组装有问题，或者近源物种本身和你的物种共线性不好也有可能；

回答于 2024-05-03 10:47

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只是警告信息，没有看到报错；可能你的过滤条件太严没有结果了；你降低过滤条件，看看有没有结果吧；

回答于 2024-05-01 09:13

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这个需要看数据测试看看才知道，你看看这几个缺失的基因序列有没有特殊吧；

回答于 2024-04-30 10:18

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检查对应的红色路径文件是否存在，ls cd过去看看的；

回答于 2024-04-30 10:15

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计算机不会错的，你在按照提示检查bed文件和simple文件之间基因ID是否对应；文件名字或者路径错了，打开的文件搞错了等等；

回答于 2024-04-29 12:17

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输入文件都打开看看有没有异常，多余的空行删除；文件里面的染色体ID要对应等；

回答于 2024-04-28 22:15

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进化树上有外群就可以转化成有根树

回答于 2024-04-28 13:51

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再核对核对氨基酸编码吧，看看有没有非法的字符在里面；

回答于 2024-04-26 13:41

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进化树一样的，用其中一个发文章就行了；干嘛要一模一样；枝可以旋转看上去不一样其实都是一样的：

回答于 2024-04-26 13:32