存在说明以及有了,你就可以跳过建立文件夹这步; Linux基础不好一定要学习以下课程: linux系统使用
回答于 2020-03-19 18:54
这步perl只是提取了 GTF文件中不同ID的对应关系; 后面的基因富集用的clusterprofile 这个R包你可以看看帮助;
回答于 2020-03-19 18:53
序列差异太大,你适当删除些GAP重新构建进化树:https://www.omicsclass.com/question/832
回答于 2020-03-19 18:50
可能是权限问题,你看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1116
回答于 2020-03-19 18:48
可以的,参考这个文章:https://www.omicsclass.com/article/760
回答于 2020-03-19 18:47
可能是系统原因,看看这个:https://www.omicsclass.com/question/1622
回答于 2020-03-19 18:46
这个问题可以写个perl脚本或者python脚本完成,分别用bioperl或者biopython包处理fasta文件会很方便,有相应课程; 不用bioperl 给你个写脚本思路:首先把ID的对应关系读到一个hash中,然后判断只接处理ID行,也就是带有>的行,其他行输出就行; 生物信息入门到精通必修基础课:、perl语言高级、python语言入门到精...
回答于 2020-03-19 18:44
这个问题可以写个perl脚本或者python脚本完成,分别用bioperl或者biopython包处理fasta文件会很方便,有相应课程; 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、p...
回答于 2020-03-19 18:42
这个问题可以写个perl脚本或者python脚本完成,分别用bioperl或者biopython包就可以的,有相应课程; 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门...
回答于 2020-03-19 18:40
方法1,分别用hmmer搜索,再取交集. 方法2,把三个文件cat合并在一起,得到all.hmm文件,直接用hmm搜索;但是得到的结果你也是需要筛选的; 最后,没有说一下就得到同时具有三个结构域的方法,都需要前期搜索,后期筛选才能等到。 更多分析见:学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2020-03-18 09:16